Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,020,838 | T→C | 8.7% | V251A (GTG→GCG) | fliM → | flagellar motor switching and energizing component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,020,838 | 0 | T | C | 8.7% | 416.7 / 23.8 | 140 | V251A (GTG→GCG) | fliM | flagellar motor switching and energizing component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (78/47); new base C (5/7); total (83/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.17e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.27e-03 |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TGAAGGCTATAGCGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTGCGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATATCACCACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGAACAGCCCAAATGAGTGACATGAATAATCCG > NC_000913/2020572‑2021108 | tGAAGGCTATAGCGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTACGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATATCACCACCTCGCCGAACGACATTGTAGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTCACCCGCCGCTGGACAACTCGCGTAATGAATATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAg > 2:407995/1‑274 (MQ=255) ggCCATAGCGACGCCTGGAAGGCGAGTAATCCGCTGGAAGTTGAGGACGTGCGGTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACAAATATCACCACCCCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGAATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgca < 2:19982/275‑1 (MQ=255) gCTATAGCGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTGCGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATATCACCACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTTCGACAGGTgcag > 2:167249/1‑275 (MQ=255) taGGGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTGCGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATTTCACAACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgca < 2:149886/270‑1 (MQ=255) aCGTGCGTTCGGAAATGCAGGTGAACTTTACCAATATCACCACCTCGCCGCACGACATTGTGGTTAACACACCGTTCCATATGGAGATTGGCAACCTGACCGGCCAATTTAATCGCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGCGCCGCTACGGGAATTGTTGGGTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTCATCACGCACAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCTCCAGATGCAACACTCCCAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTCGCCGattttccgccc > 4:561107/1‑266 (MQ=255) atCACCACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGa > 2:103400/1‑275 (MQ=255) caccTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGCAAANTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAAACTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCNAACTTTTCCGATATCTCGCTCCCCCTTCCGNNACTTTTAACACAGACAccccccgcactcc > 3:89484/1‑266 (MQ=255) cGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTTCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCAGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCTACGTCCTACCg > 2:620641/1‑275 (MQ=255) cGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagctg > 2:210375/1‑203 (MQ=255) cGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTAGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCg > 2:363659/1‑275 (MQ=255) acGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGt > 8:393514/1‑149 (MQ=255) cGCCTTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAAGTTAATATCTGCCTGCCAGTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGAGCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGcatcat < 1:154976/274‑1 (MQ=255) cATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGAGCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGt > 8:436871/1‑149 (MQ=255) aggtgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTg < 8:896174/147‑1 (MQ=255) tgtgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgc > 5:112109/1‑149 (MQ=255) gtgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGt > 6:228243/1‑146 (MQ=255) tgGAGATTGGCAACCTGACCGGGGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc < 8:617273/149‑5 (MQ=255) tgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc < 6:954903/149‑5 (MQ=255) ggAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAACAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACg > 2:243283/1‑275 (MQ=255) agaTTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTAGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACCGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCTACGTCCTTCCGAAAGAAAACCCCGATACCATCCTCCCCCaatgttccgg > 4:453171/1‑265 (MQ=255) ttGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTca < 7:703497/149‑1 (MQ=255) tGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTc < 4:199312/147‑1 (MQ=255) ggCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTcaca > 8:647068/1‑149 (MQ=255) ggCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTcaca < 5:632381/149‑1 (MQ=255) gCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACag > 5:434064/1‑149 (MQ=255) cAACCTGAACGACGAATTGAATATCGGCCACCCGATCAGCATGATCGGGCCGCTAAGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAGGCTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCACGTTAACCTGGGGCGCCAGATGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTAGCCAAC‑GTGCCGATAACTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGt < 4:211934/275‑1 (MQ=255) cTGACCGTCTAATGTAACATCTACCTGCCATTCGGCGTGATCCAGCCGGTACGGGGATTGTTGGTTAACCCGCCTCTGGAAAACACGCGTAATGAAGGTCAGAGCTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAACATTCACAGCTGGCGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGACGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTg < 1:196737/273‑1 (MQ=255) aCCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGCTTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGACCATGTTGACGGCGTCCCGGtcgtga > 1:5157/1‑269 (MQ=255) cGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc > 6:1007896/1‑126 (MQ=255) cGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc < 5:1007896/130‑5 (MQ=255) ggCTAATTTAAGATCTGCCTGCCATGAAGCATGAGCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAAGGAAGATCAGAACTGGCGCGAGAACCTGGGGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTTATCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTAGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACca < 1:74835/274‑1 (MQ=255) gCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagctg > 6:99560/1‑146 (MQ=255) gCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagctg < 5:99560/146‑1 (MQ=255) aaTTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGcc > 8:189289/1‑149 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgca < 6:745613/122‑1 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgca > 5:745613/1‑122 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCaa > 5:79851/1‑149 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttat < 7:516198/122‑4 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttat > 8:516198/1‑119 (MQ=255) ttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAAc > 8:906308/1‑149 (MQ=255) ttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAAc > 8:339116/1‑149 (MQ=255) aaTATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACtt > 5:664383/1‑149 (MQ=255) tCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGcc > 7:194106/1‑149 (MQ=255) gcctgccATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGat < 7:574823/149‑1 (MQ=255) gccggcaATTCAGCATGATCGAGCGGTTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCt < 2:561107/274‑1 (MQ=255) cctgccATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCa > 2:573618/1‑275 (MQ=255) aTTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGc > 8:31935/1‑149 (MQ=255) aGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACg > 8:601912/1‑149 (MQ=255) cATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGcc > 7:714447/1‑149 (MQ=255) aTGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCt > 6:211613/1‑149 (MQ=255) aTGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc > 8:78864/1‑95 (MQ=255) aTCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTc < 8:257368/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTc > 8:150163/1‑149 (MQ=255) gAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTGGCTACGCCTGTCGCa > 7:831227/1‑149 (MQ=255) gAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCa > 6:1034369/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCCTTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCCGCTTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGCCGTCCTGCCCATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCCTCCCGGTGCTGGCCAGCCAGTATGGCACCCTCACCGGTCAGTATGCGttctg > 1:79418/1‑271 (MQ=255) aGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAACGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACgg > 2:292710/1‑275 (MQ=255) ccGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATNCCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAAACCGAGCGCNAACTCACCCCTGTTTACGGCGCCCCGGTGCTCACCAACCCGTATGNGNCCCCCCACGGCCAGTCTCCGtttccttt > 3:59765/1‑269 (MQ=255) cGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTg > 7:333003/1‑86 (MQ=255) cGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAtt < 5:303727/149‑1 (MQ=255) gggAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTaaaa < 7:321910/149‑1 (MQ=255) gaaatgtatgGTTAACACGCCACGGGAAAACCCGCGGAATGAAGACCAGAACTGGCTCGGTAACCTGTGGCGCCAGATGCAGCAGTCCAAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTAGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGACGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCGGACAGTATGGCACCCGAAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACAt < 4:407995/266‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGa > 7:874606/1‑149 (MQ=255) ttgttgGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGa‑a > 6:610912/1‑149 (MQ=255) gTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGTTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCgg > 7:25628/1‑149 (MQ=255) tAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTCTTGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTCAGGATAGAACATTTGATTAACCCGa > 2:636275/1‑275 (MQ=255) tAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCACGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCaa > 2:341123/1‑234 (MQ=255) ccgccgCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCACGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGt < 4:341123/234‑1 (MQ=255) cgccgcTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTc > 7:378154/1‑149 (MQ=255) gAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGAt < 8:660479/149‑1 (MQ=255) aaaaCTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATa > 6:410187/1‑149 (MQ=255) cTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaa > 7:68694/1‑149 (MQ=255) cTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGt > 2:448803/1‑220 (MQ=255) tggcgTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaaa > 8:741863/3‑149 (MQ=255) gcgTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAg > 4:251350/1‑274 (MQ=255) cgTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGt < 4:448803/220‑1 (MQ=255) gTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGa < 4:103400/274‑1 (MQ=255) aaTGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGa > 7:1046484/1‑149 (MQ=255) aaTGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGaa < 2:251350/273‑1 (MQ=255) aGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGca < 7:484060/149‑1 (MQ=255) gATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGcat > 5:255659/1‑149 (MQ=255) aTCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGCTAGAAAAACCCGATCGcatc > 5:225818/1‑149 (MQ=255) cAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGcatcat > 7:4595/1‑149 (MQ=255) cAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGcatcat < 6:457621/149‑1 (MQ=255) aGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCatcatc < 8:831227/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGAACAGCCCAAAGGGGTg > 2:570415/1‑274 (MQ=255) gcgcGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCAGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCGCGCTACTCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATg > 8:485962/1‑149 (MQ=255) gATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGa > 5:836915/1‑149 (MQ=255) tgcaCCTGGCGCACCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGAc < 5:399284/146‑1 (MQ=255) tgcaCCTGGCGCACCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGAc > 6:399284/4‑149 (MQ=255) aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGAc < 6:395165/149‑1 (MQ=255) aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGAACAGCCCAAAt > 4:641100/1‑261 (MQ=255) aCCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc > 7:552366/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGAACAGCCCAAATGAGt < 2:641100/261‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt > 8:213073/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt < 7:601912/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCCACGGTCAGTATGCGTTACGGCTAGAACCTTTGATTAACCCGATTTTGAATTCTCTGAAAGAGGAACAGCCCAAATAAGTGACATGAATAATccc > 2:622948/1‑274 (MQ=255) tGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc < 5:857650/146‑1 (MQ=255) tGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc > 6:857650/1‑146 (MQ=255) tGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTc > 5:886707/1‑149 (MQ=255) | TGAAGGCTATAGCGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTGCGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATATCACCACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGAACAGCCCAAATGAGTGACATGAATAATCCG > NC_000913/2020572‑2021108 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |