| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3814121 = | 501 (4.170) | 5 (0.040) | 5/248 | NT | 1.0% | coding (190/456 nt) | dut | deoxyuridinetriphosphatase |
| ? | NC_000913 | 3814140 = | 489 (4.270) | coding (209/456 nt) | dut | deoxyuridinetriphosphatase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 553 total aligned reads displayed.
GAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGG > NC_000913/3813973‑3814269 | gaaggaaTTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTgg > 2:219917/1‑149 (MQ=255) ggaaTTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTggcgg > 2:1042235/1‑149 (MQ=255) aTTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCa‑‑a < 1:524875/149‑1 (MQ=255) tttCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTggc > 3:39572/1‑143 (MQ=255) ccGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑atgat < 1:546532/149‑1 (MQ=255) gACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCcgc > 3:496750/1‑149 (MQ=255) ttgaatggtgaagctgtcctgaccacggttccacacggaaatcatcaactggccctgatagtcagaatcgatcaatcctaccaggttaccaagcacgataccgtgcttatgtcccaatccggagcgc < 2:966138‑M1/2‑1 (MQ=255) aTGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTcc < 4:119366/149‑1 (MQ=255) gCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATACTGCCGCGCTCCgg < 3:83274/149‑1 (MQ=255) aCCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGAtt > 2:25126/1‑149 (MQ=255) ccTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTg < 4:236592/149‑1 (MQ=255) ctctGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTgg > 1:465433/1‑149 (MQ=255) ctctGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTgg < 2:574401/149‑1 (MQ=255) ctctGATTCTGCCGGACTGGACCTGCGTGCCTGTATCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACCCTATGATGCTTCAGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTgg > 2:699855/1‑149 (MQ=255) tGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGAc < 2:767975/149‑1 (MQ=255) tGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGAc > 2:722168/1‑149 (MQ=255) gCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCAGGGTGACACTATGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGCTTGGGACAt > 4:748416/1‑149 (MQ=255) tctTCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTg > 1:943484/1‑141 (MQ=255) ccGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTggcg > 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ttCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAg < 2:411228/149‑1 (MQ=255) ttCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAg < 2:635302/149‑1 (MQ=255) atTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAg > 2:472172/1‑149 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGc < 4:507519/149‑1 (MQ=255) gtcccaatccggagcGCGGCAGCATCAT‑‑TGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGa < 4:536227‑M1/83‑1 (MQ=255) gCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTc < 3:53706/95‑1 (MQ=255) gATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCAc > 2:673574/1‑149 (MQ=255) aTCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTa < 3:353241/77‑1 (MQ=255) cTTCACTGGCGACA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATCATTTCCGTGTGGAAGCGTGGTCAGGACAGCTTCACCAtt > 3:712638/1‑149 (MQ=255) ttCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTcc > 2:873076/1‑115 (MQ=255) ttCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTc > 1:1081979/1‑149 (MQ=255) cACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCaa > 1:230734/1‑149 (MQ=255) aCTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCCTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCACGACAGCTTCACCATTCAAc < 4:680578/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtgat < 3:96459/103‑1 (MQ=255) tGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCt > 3:233836/1‑149 (MQ=255) GCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTgg > 2:114594‑M1/1‑149 (MQ=255) | GAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCA‑‑ATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGG > NC_000913/3813973‑3814269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |