New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1754899 = | 103 (0.860) | 5 (0.040) | 5/242 | NT | 5.2% | intergenic (‑422/+33) | ydhY/ydhZ | putative 4Fe‑4S ferridoxin‑type protein; FNR, Nar, NarP‑regulated protein; putative subunit of YdhYVWXUT oxidoreductase complex/uncharacterized protein |
? | NC_000913 | 1754928 = | 88 (0.790) | intergenic (‑451/+4) | ydhY/ydhZ | putative 4Fe‑4S ferridoxin‑type protein; FNR, Nar, NarP‑regulated protein; putative subunit of YdhYVWXUT oxidoreductase complex/uncharacterized protein |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTCATTGCAGAAAATAAAAATAACATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCATTTCCAG > NC_000913/1754780‑1755075 | ttCATTGCAGAAAATAAAAATAACATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGaa < 3:863534/149‑1 (MQ=255) aaaataaaaataACATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCAtttt > 4:295039/1‑149 (MQ=255) aaaataaaaataACATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCATATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATTAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATAGTCAtttt > 4:663040/1‑149 (MQ=255) tatcgcaggcgtattacgtacagcattagccaataaacgcattcagcgcagtgagctggaaaagcaggcgatggaaaccgtcattaacgcactggtaaaatgaccattcaggatgaagcttaccgcctcatcctgaATGGTCATTTTAc < 2:658581‑M2/13‑1 (MQ=255) aataaaaataaCATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTAc < 2:141009/149‑1 (MQ=255) ataaaaataaCATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTAcc > 1:786919/1‑149 (MQ=255) taaaaataaCATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCa > 3:363807/1‑149 (MQ=255) aaataaCATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTg > 2:1047486/1‑149 (MQ=255) taaCATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTCGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGt > 4:788412/1‑149 (MQ=255) aaCATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGtt < 3:946317/149‑1 (MQ=255) ataaTCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATTATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAAt < 3:1027201/146‑1 (MQ=255) aTTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAAt > 1:34659/1‑149 (MQ=255) ttATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATg > 1:1048442/1‑149 (MQ=255) tATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGa < 3:369388/149‑1 (MQ=255) aTCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGAc < 3:530173/149‑1 (MQ=255) aTCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGAc < 2:208180/149‑1 (MQ=255) gCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGt > 1:101235/1‑149 (MQ=255) gCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCATTAATGACGGt > 3:235063/1‑149 (MQ=255) tataAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGttt > 2:583787/1‑149 (MQ=255) aaaTTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCa < 2:487895/149‑1 (MQ=255) aTTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATc < 1:38488/149‑1 (MQ=255) ttAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCg > 1:724539/1‑149 (MQ=255) caaaaTACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGc < 4:445976/148‑1 (MQ=255) aaaaTACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGcc < 1:209316/149‑1 (MQ=255) aaaTACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCt > 2:546822/1‑149 (MQ=255) atacatacCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCt < 3:1029646/147‑1 (MQ=255) atacatacCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGc < 2:479118/149‑1 (MQ=255) atacatacCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATCAACTGGACCGCAGCTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGGCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCt > 4:1029646/1‑147 (MQ=255) acatacCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCtt < 4:177320/149‑1 (MQ=255) atacCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTGGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCATTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCtttt > 3:674994/1‑149 (MQ=255) atacCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCtttt < 1:1004933/149‑1 (MQ=255) atacCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACAGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCtttt < 2:452752/149‑1 (MQ=255) acgcattcagcgcagtgagctggaaaagcaggcgatggaaaccgtcattaacgcactggtaaaatgaccatTCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATg < 4:1067212‑M1/32‑1 (MQ=255) acCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTcc < 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(MQ=255) TCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGa > 1:222262‑M1/1‑134 (MQ=255) TCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTg < 2:584715‑M1/149‑1 (MQ=255) TCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTg < 3:200515‑M1/149‑1 (MQ=255) ATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTcc > 1:69196‑M1/1‑149 (MQ=255) ATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTcc > 3:676981‑M1/1‑149 (MQ=255) ATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTcc > 2:1065157‑M1/1‑149 (MQ=255) tgaggcggtaagcttcatcctgaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCt > 1:462449‑M2/24‑149 (MQ=255) aGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGcc > 3:790103/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGATAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGGTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGccc < 4:674994/149‑1 (MQ=255) gCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGccc > 3:981448/1‑149 (MQ=255) ccacatcctgaATGGTCATTTTTCCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAGTGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATACTCTTTGTTTCCTGCCCCAGATcgc > 2:290016‑M2/12‑149 (MQ=255) tcctgaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCAtt > 3:195419‑M2/7‑149 (MQ=255) cctgaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCAttt > 4:618063‑M2/6‑149 (MQ=255) ctgaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGATGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCATTTc > 2:386399‑M2/5‑149 (MQ=255) ctgaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTa < 2:356305‑M2/89‑1 (MQ=255) tgaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGCTCGCGCATTTcc < 4:195419‑M2/146‑1 (MQ=255) gaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCATTTCCa < 1:983125‑M2/147‑1 (MQ=255) gaATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCATTTCCa > 2:34531‑M2/3‑149 (MQ=255) gaATGGTCATTTTACCAGTGCATTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCATTTCCa < 4:235063‑M2/147‑1 (MQ=255) aATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCATTTCCAg < 4:816583‑M2/148‑1 (MQ=255) | TTCATTGCAGAAAATAAAAATAACATTATCGCTATAAATTAAAATACATACCGAAATTCGTATAATTTCAGCAGTTGTTATTTAGAATGATTAACTGGACCGCAACTGAAGCAAGAATATCAGGATGAAGCTTACCGCCTCATCCTGAATGGTCATTTTACCAGTGCGTTAATGACGGTTTCCATCGCCTGCTTTTCCAGCTCACTGCGCTGAATGCGTTTATTGGCTAATGCTGTACGTAATACGCCTGCGATAACAATATGCTTTGGTTCCTGCCCCAGATCGCGCATTTCCAG > NC_000913/1754780‑1755075 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |