| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,020,841 | G→A | 14.6% | R252H (CGC→CAC) | fliM → | flagellar motor switching and energizing component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,020,841 | 0 | G | A | 14.6% | 227.1 / 28.3 | 89 | R252H (CGC→CAC) | fliM | flagellar motor switching and energizing component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/28); new base A (5/8); total (53/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.28e-01 | |||||||||||
GTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTG > NC_000913/2020695‑2020989 | gTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCAcc < 3:932439/149‑1 (MQ=255) tCCATGTTGAAATTGGCAACCTGACCGGCCAAATTAATAACTTCCCGCCATTCAGCATTATCCGGCCGCCACGGGAATTTTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAg < 3:489948/149‑1 (MQ=255) cATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGAGCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGt > 4:436871/1‑149 (MQ=255) aggtgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTg < 4:896174/147‑1 (MQ=255) tgtgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgc > 1:112109/1‑149 (MQ=255) gtgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGt < 1:228243/146‑1 (MQ=255) gtgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGt > 2:228243/1‑146 (MQ=255) tgGAGATTGGCAACCTGACCGGGGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc < 4:617273/149‑5 (MQ=255) tgGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc < 2:954903/149‑5 (MQ=255) gaTTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCAtt < 1:310486/149‑1 (MQ=255) ttGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTca < 3:703497/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTcaca < 1:632381/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTcaca > 4:647068/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACag > 1:434064/1‑149 (MQ=255) cGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc < 1:1007896/130‑5 (MQ=255) cGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc > 2:1007896/1‑126 (MQ=255) gCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagctg > 2:99560/1‑146 (MQ=255) gCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACagctggagctg < 1:99560/146‑1 (MQ=255) aaTTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGcc > 4:189289/1‑149 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgca > 1:745613/1‑122 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTgca < 2:745613/122‑1 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCaa > 1:79851/1‑149 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttat > 4:516198/1‑119 (MQ=255) tttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttat < 3:516198/122‑4 (MQ=255) ttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAAc > 4:339116/1‑149 (MQ=255) ttAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAAc > 4:906308/1‑149 (MQ=255) aaTATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACtt > 1:664383/1‑149 (MQ=255) atatCTGCCTGCCATTCAGCGTGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACttt > 2:647139/1‑149 (MQ=255) tCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGcc > 3:194106/1‑149 (MQ=255) gcctgccATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGat < 3:574823/149‑1 (MQ=255) cctgccATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTTGAAAACTCGCGTAATGAAAATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGata < 4:562476/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGc > 4:31935/1‑149 (MQ=255) cAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATATCCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTAc < 4:622560/149‑1 (MQ=255) aGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACg > 4:484060/1‑149 (MQ=255) aGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACg > 4:601912/1‑149 (MQ=255) gCATGATCGAGACGATACGGGAATTGTAGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGc < 4:7593/149‑1 (MQ=255) cATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGcc > 3:714447/1‑149 (MQ=255) aTGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCt > 2:211613/1‑149 (MQ=255) aTGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc > 4:78864/1‑95 (MQ=255) aTGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGCGCACCAGGttatc < 3:78864/99‑5 (MQ=255) aTCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTc < 4:257368/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTc > 4:150163/1‑149 (MQ=255) gAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTGGCTACGCCTGTCGCa > 3:831227/1‑149 (MQ=255) gAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCa > 2:1034369/1‑149 (MQ=255) cGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTg < 4:333003/86‑1 (MQ=255) cGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTg > 3:333003/1‑86 (MQ=255) cGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAtt < 1:303727/149‑1 (MQ=255) cGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGAtt < 1:978347/149‑1 (MQ=255) gggAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTaaaa < 3:321910/149‑1 (MQ=255) gggAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTaaaa > 2:1094461/1‑149 (MQ=255) gAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACt > 3:55414/1‑149 (MQ=255) aTTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGa > 3:874606/1‑149 (MQ=255) ttgttgGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGaa > 2:610912/1‑149 (MQ=255) gTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGTTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCgg > 3:25628/1‑149 (MQ=255) gTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCgg > 3:700215/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTc > 3:378154/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTc < 3:429331/149‑1 (MQ=255) tGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCg > 2:372681/1‑149 (MQ=255) gAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGAt < 4:660479/149‑1 (MQ=255) aaaaCTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATa < 4:874606/149‑1 (MQ=255) aaaaCTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATa < 2:900868/149‑1 (MQ=255) aaaaCTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATa > 2:410187/1‑149 (MQ=255) cTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaa > 3:68694/1‑149 (MQ=255) tggcgTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGaaaa > 4:741863/3‑149 (MQ=255) gTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAAccc < 1:610912/149‑1 (MQ=255) gTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAAccc < 2:434064/149‑1 (MQ=255) aaTGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGa > 3:1046484/1‑149 (MQ=255) 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cAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGcatcat > 3:4595/1‑149 (MQ=255) aGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCatcatc < 4:831227/149‑1 (MQ=255) gcgcGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCAGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCGCGCTACTCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATg > 4:485962/1‑149 (MQ=255) gATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGa > 1:836915/1‑149 (MQ=255) tgcaCCTGGCGCACCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGAc < 1:399284/146‑1 (MQ=255) tgcaCCTGGCGCACCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGAc > 2:399284/4‑149 (MQ=255) aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGAc < 2:395165/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc > 3:552366/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt > 4:975151/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt > 4:213074/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt > 4:213073/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt > 3:181145/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt > 3:259424/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt < 3:601912/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc < 1:857650/146‑1 (MQ=255) tGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc > 2:857650/1‑146 (MQ=255) tGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTc > 1:886707/1‑149 (MQ=255) gcCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTg < 4:4595/149‑1 (MQ=255) | GTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGAACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTG > NC_000913/2020695‑2020989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |