| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,368,982 | G→C | 8.5% | intergenic (+28/+32) | yhcG → / ← yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,368,982 | 0 | G | C | 8.5% | 486.4 / 30.5 | 141 | intergenic (+28/+32) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (73/56); new base C (7/5); total (80/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGG > NC_000913/3368837‑3369130 | tttGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtgt > 1:912906/1‑149 (MQ=255) tGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCt < 2:26227/149‑1 (MQ=255) tAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAg > 3:708876/1‑149 (MQ=255) tAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAg > 4:1013203/1‑149 (MQ=255) cacCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAAt > 3:101227/1‑149 (MQ=255) acCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATc < 2:436353/149‑1 (MQ=255) ccGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCt < 1:81783/149‑1 (MQ=255) cGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCtt < 1:748755/149‑1 (MQ=255) gTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCttt < 2:764292/149‑1 (MQ=255) gTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCttt < 3:534711/149‑1 (MQ=255) tCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaa < 4:539606/149‑1 (MQ=255) tGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaa < 1:453756/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATGTTTAAAAc < 3:759357/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAg > 1:220245/1‑127 (MQ=255) gCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAg < 2:220245/127‑1 (MQ=255) gCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaa > 4:635360/1‑147 (MQ=255) gCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaa < 3:635360/147‑1 (MQ=255) aaGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATTTTTAAAACGaa < 2:134521/149‑1 (MQ=255) aaGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGaa > 1:966474/1‑149 (MQ=255) aaGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGaa > 3:256641/1‑149 (MQ=255) aaGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGaa > 2:686421/1‑149 (MQ=255) aaGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAAGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGaa < 1:596709/149‑1 (MQ=255) aaGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGACAAATGACTCGCAGATGAACTCGTTCAAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAAGCTATAGACGCCGTTAATTGCAGCGTTGTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGGAGAATCTTTAAAACGaa < 4:667825/149‑1 (MQ=255) atatAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCAAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGt < 4:612492/149‑1 (MQ=255) tataAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGtt > 2:743540/1‑149 (MQ=255) taAGATGCAACTACCTGAAGAGAAACGACTCGAAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGGTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTCCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACAAACTAAGtttt > 4:97861/1‑149 (MQ=255) taAAATGCAACTAACTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTAGTTCGAACACAGGCTGTGCTAGAGGAAGGCTATATACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGAAGAATCTTTAAAACGAACTAAGtttt > 2:294556/1‑149 (MQ=255) aGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGGTGAACTCGTTCGAACACAGGCGGGGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTaa < 2:347645/149‑1 (MQ=255) gATGCAACTAGCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAg > 3:68549/1‑149 (MQ=255) aTGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGc < 2:321509/149‑1 (MQ=255) gCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCa < 3:415745/149‑1 (MQ=255) gCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCa < 4:853165/149‑1 (MQ=255) aaCTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCAtt > 4:560006/1‑149 (MQ=255) aaCTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCAtt > 3:1031637/1‑149 (MQ=255) aaCGACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCAtt > 1:950018/1‑149 (MQ=255) cTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTaa > 4:92376/1‑149 (MQ=255) cTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCa > 3:378690/1‑149 (MQ=255) cTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCa < 3:92376/149‑1 (MQ=255) cTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCa < 4:256641/149‑1 (MQ=255) tgatgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAg > 2:1022598/1‑149 (MQ=255) gatgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGc < 3:905074/149‑1 (MQ=255) gatgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGc > 1:420707/1‑149 (MQ=255) atgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGcc > 2:319624/1‑149 (MQ=255) atgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGcc > 3:1036720/1‑149 (MQ=255) gagaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCa < 4:815780/136‑1 (MQ=255) gagaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCa > 3:815780/1‑136 (MQ=255) gaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTaa < 2:437757/149‑1 (MQ=255) aaaCGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAAc < 4:900334/149‑1 (MQ=255) aCTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTca > 4:258944/1‑149 (MQ=255) tCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcacc > 1:168374/1‑149 (MQ=255) tCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcacc > 1:83613/1‑149 (MQ=255) aGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACaa < 3:258944/149‑1 (MQ=255) gAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtt > 3:691736/1‑149 (MQ=255) aaCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCttt > 1:1076317/1‑149 (MQ=255) aCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtttt < 2:931894/149‑1 (MQ=255) aCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtttt < 4:682266/149‑1 (MQ=255) cTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCttttt > 2:907474/1‑149 (MQ=255) cTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCttttt > 1:618119/1‑149 (MQ=255) gTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAt < 2:366234/149‑1 (MQ=255) gTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAt < 2:72461/149‑1 (MQ=255) gTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAt > 1:716048/1‑149 (MQ=255) cGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAtctc < 2:207308/149‑1 (MQ=255) acacAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTcc < 1:684404/149‑1 (MQ=255) acacAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTcc > 3:378286/1‑149 (MQ=255) acaGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAg > 1:380662/1‑149 (MQ=255) acaGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAg > 1:1072159/1‑149 (MQ=255) cTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGAc > 2:988129/1‑149 (MQ=255) tAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACa > 4:335926/1‑149 (MQ=255) tAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACa > 4:35216/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGtt < 4:345882/80‑1 (MQ=255) gAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGtt > 3:345882/1‑80 (MQ=255) tataGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAg < 1:872256/127‑1 (MQ=255) tataGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAg > 2:872256/1‑127 (MQ=255) tataGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTgg < 1:907474/149‑1 (MQ=255) aGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAGCCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGttt < 3:560006/149‑1 (MQ=255) aGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGttt < 4:1031637/149‑1 (MQ=255) cGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATg < 1:195059/149‑1 (MQ=255) gTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGt > 1:1080838/1‑149 (MQ=255) gTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGt > 2:1078167/1‑149 (MQ=255) gTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGt < 4:708876/149‑1 (MQ=255) gTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGt > 3:648344/1‑149 (MQ=255) gTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGt > 4:779634/1‑149 (MQ=255) aaTTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCa > 3:324279/1‑149 (MQ=255) aaTTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCa < 2:971126/149‑1 (MQ=255) aaTTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCa > 1:746142/1‑149 (MQ=255) tttCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCAcc > 4:205476/1‑149 (MQ=255) tttCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCAcc > 3:754146/1‑149 (MQ=255) aaagaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTaa < 4:128570/88‑1 (MQ=255) aaagaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTaa > 3:128570/5‑92 (MQ=255) gaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCACCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACgg > 1:323696/2‑149 (MQ=255) ttCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCg > 1:172886/1‑149 (MQ=255) ttCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCg > 4:537310/1‑149 (MQ=255) cTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTACTCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGaa < 4:378690/149‑1 (MQ=255) cTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACaa > 2:701559/1‑106 (MQ=255) cTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACaa < 1:701559/106‑1 (MQ=255) aGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACAtt > 3:414213/1‑149 (MQ=255) aCAGTGTCTGCGGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTcc > 3:613279/1‑149 (MQ=255) aCAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTcc > 4:108448/1‑149 (MQ=255) gtgtCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCgg > 1:8509/1‑149 (MQ=255) gtgtCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACACATCCTGCTTTATCCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCgg > 4:804150/1‑149 (MQ=255) | TTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGG > NC_000913/3368837‑3369130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |