| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,720,802 | A→C | 6.0% | T41T (ACA→ACC) | insJ → | IS150 transposase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,720,802 | 0 | A | C | 6.0% | 585.9 / 24.3 | 168 | T41T (ACA→ACC) | insJ | IS150 transposase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (74/84); new base C (2/8); total (76/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAGGCTGCTGCTCACTTTAT > NC_000913/3720657‑3720948 | gATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCATGTCCTGACCTgg < 3:346244/149‑1 (MQ=255)gATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATgg < 4:865504/149‑1 (MQ=255) gAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCATGTCCTGACCTGGGtt < 4:101560/149‑1 (MQ=255) gAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGtt < 4:619683/149‑1 (MQ=255) aaTGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCATGTCCTGACCTGGGttcg > 2:895594/1‑147 (MQ=255) aTGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGcc > 2:116473/1‑149 (MQ=255) tGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGccc > 2:1008780/1‑149 (MQ=255) ggAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCATGTCCTGACCTGGGttcgggg < 3:149472/149‑6 (MQ=255) gAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCctc > 2:875596/1‑149 (MQ=255) 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aCATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAGGCTGCTGCTCACTTTAt > 3:846236/1‑149 (MQ=255) aCATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAGGCTGCTGCTCACTTTAt < 3:742770/149‑1 (MQ=255) aCATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAGGCTGCTGCTCACTTTAt < 1:886414/149‑1 (MQ=255) aCATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAGGCTGCTGCTCACTTTAt < 3:1014923/149‑1 (MQ=255) | GATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAGGCTGCTGCTCACTTTAT > NC_000913/3720657‑3720948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |