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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 481,225 | 0 | T | G | 9.9% | 335.8 / 29.0 | 111 | intergenic (‑517/+29) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/54); new base G (6/5); total (52/59) | |||||||||||
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Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
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ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAg < 3:200187/139‑1 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTg > 4:944560/3‑149 (MQ=255) ttACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTAGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCAt > 1:945467/1‑149 (MQ=255) | ATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCAT > NC_000913/481077‑481373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |