New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4205219 = | 73 (1.100) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 4.2% | coding (713/1290 nt) | purD | phosphoribosylglycinamide synthetase phosphoribosylamine‑glycine ligase |
? | NC_000913 | 4205254 = | 67 (1.060) | coding (678/1290 nt) | purD | phosphoribosylglycinamide synthetase phosphoribosylamine‑glycine ligase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAA > NC_000913/4205073‑4205367 | aTTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTAcc > 1:63518/1‑149 (MQ=255) ttCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCg > 1:5898/1‑149 (MQ=255) ttCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCg > 2:470015/1‑149 (MQ=255) tCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCgg > 4:202977/1‑149 (MQ=255) acgcgggtcatcgcatcgttatcgaagagttcctcgatggcgaagaagcgagctttatcgtgatggtggacggcgagcatgtgctgccgatggctaccagccaggatcacaaacgcgtaggcgataaagataccggaccaaacACCGgc > 3:476104‑M1/144‑149 (MQ=255) aaTAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGgcg > 1:238367/1‑149 (MQ=255) aCCTTCGGATTGACCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCggg < 2:287106/149‑1 (MQ=255) ttCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGa < 1:346279/149‑1 (MQ=255) ttCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGa > 4:414614/1‑149 (MQ=255) ttCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTGCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGa < 2:40872/149‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGcc < 3:349874/149‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGcc > 1:578982/1‑149 (MQ=255) cTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCa > 3:271978/1‑149 (MQ=255) cTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCa > 1:173747/1‑149 (MQ=255) 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aCGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGcttc < 3:414614/149‑1 (MQ=255) tCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCttcttc > 3:255834/1‑149 (MQ=255) aTCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGc > 1:137401/1‑149 (MQ=255) tCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGcc > 2:432555/1‑149 (MQ=255) ggTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCAt < 2:577384/149‑1 (MQ=255) gTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCttcttc > 4:198137/1‑143 (MQ=255) gTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCttcttc < 3:198137/143‑1 (MQ=255) tactacCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGa > 2:184828/1‑149 (MQ=255) actacCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAg < 4:510280/149‑1 (MQ=255) ctacCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAgg < 1:375943/149‑1 (MQ=255) ACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGaa > 3:428774‑M1/1‑149 (MQ=255) ACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGaa > 3:197751‑M1/1‑149 (MQ=255) | ATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAA > NC_000913/4205073‑4205367 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |