| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,561,969 | A→T | 7.4% | intergenic (‑146/‑44) | glpE ← / → glpD | thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)/sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,561,969 | 0 | A | T | 7.4% | 281.4 / 9.7 | 81 | intergenic (‑146/‑44) | glpE/glpD | thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)/sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/41); new base T (3/3); total (37/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CATGCGTCTCTCTTTCTTTACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGCTGATGCTGGAGGCGC > NC_000913/3561821‑3562115 | cATGCGTCTCTCTTTCTTTACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGa < 1:141862/149‑1 (MQ=255)cATGCGTCTCTCTTTCTTTACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGa < 4:435682/149‑1 (MQ=255)cATGCGTCTCTCTTTCTTTACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGa < 1:432532/149‑1 (MQ=255) aTGCGTCTCTCTTTCTTTACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGAt > 4:29500/1‑149 (MQ=255) ctctTTCTTTACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGTTATCGAACa > 1:103978/1‑149 (MQ=255) tttctttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGTACAttt > 3:412409/1‑149 (MQ=255) tctttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGTTATCGAACAtatta < 2:103978/149‑5 (MQ=255) tctttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTAt < 2:513919/149‑1 (MQ=255) tctttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTAt < 4:303298/149‑1 (MQ=255) tctttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTAt < 2:61185/149‑1 (MQ=255) tttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGTTATCGAACAtatta < 3:29578/147‑5 (MQ=255) tttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGTTATCGAACAtatta > 4:29578/1‑143 (MQ=255) tttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGa < 2:368984/149‑1 (MQ=255) tttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGa < 4:445244/149‑1 (MQ=255) tttACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGa > 1:156889/1‑149 (MQ=255) aaacaaGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCttt > 1:397195/1‑149 (MQ=255) aaacaaGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCttt > 4:548563/1‑149 (MQ=255) aacaaGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTa > 2:223520/1‑149 (MQ=255) acaaGTTGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTaa < 1:226836/149‑1 (MQ=255) acaaGTGGGAAAATTTTCCGCACAGTTAACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCAATAATGTTATCCATATCACTTTAAAATGTTTTTTCATTGTAACCT‑AAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAAc < 3:174181/149‑1 (MQ=255) caaGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAAc < 3:125690/149‑1 (MQ=255) tGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGaaa < 2:96847/149‑1 (MQ=255) tGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGaaa < 3:372213/149‑1 (MQ=255) tGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGaaa > 1:163313/1‑149 (MQ=255) gCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTg > 3:145281/1‑149 (MQ=255) gCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTg > 4:22370/1‑149 (MQ=255) aaaTTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGaa > 4:51135/1‑149 (MQ=255) aaTTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAAt < 1:45727/149‑1 (MQ=255) aTTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATg > 2:53012/1‑149 (MQ=255) tACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAgg < 2:156889/149‑1 (MQ=255) tACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAgg < 4:412409/149‑1 (MQ=255) tACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAgg < 1:365575/149‑1 (MQ=255) ccGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGgc > 3:589498/1‑149 (MQ=255) gTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATgg < 3:51135/149‑1 (MQ=255) ttACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGaa < 2:214457/149‑1 (MQ=255) gTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAgg < 3:61557/134‑1 (MQ=255) gTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAgg > 4:61557/1‑134 (MQ=255) tCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCaa > 2:113058/1‑149 (MQ=255) cGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCaaa < 2:214045/149‑1 (MQ=255) cGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCaaa < 2:397195/149‑1 (MQ=255) aaGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGa < 3:287115/149‑1 (MQ=255) aGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGAt < 4:145281/149‑1 (MQ=255) aGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGAt < 3:548563/149‑1 (MQ=255) cGGCAGATAAACCCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAGTGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTACTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTGTAACGAAAGGGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCt > 4:465162/1‑149 (MQ=255) 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tAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGggc < 3:22370/149‑1 (MQ=255) ttATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAgg < 4:27606/106‑1 (MQ=255) ttATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAgg > 3:27606/1‑106 (MQ=255) taCATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAAt < 4:203395/99‑1 (MQ=255) taCATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAAt > 3:203395/1‑99 (MQ=255) aCATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAAt < 2:88273/149‑1 (MQ=255) cATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATg < 3:559494/149‑1 (MQ=255) aCTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTg > 3:616826/1‑149 (MQ=255) tctAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGt > 4:187341/1‑149 (MQ=255) aaTGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATcgc < 3:187341/149‑1 (MQ=255) aaTGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATcgc > 3:82324/1‑149 (MQ=255) 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1:38589/1‑134 (MQ=255) tGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCt < 3:402775/149‑1 (MQ=255) ccTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGAcg > 1:378480/1‑149 (MQ=255) aaGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGt < 1:203167/149‑1 (MQ=255) gcgcGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGttt < 1:223520/149‑1 (MQ=255) gATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATcc < 4:269612/149‑1 (MQ=255) gATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATcc > 1:391602/1‑149 (MQ=255) ttCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGt > 4:223748/1‑149 (MQ=255) ttCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGt < 2:319667/149‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGc < 2:52764/149‑1 (MQ=255) cTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGCTGATg > 2:553884/1‑149 (MQ=255) tAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCgg > 4:245761/1‑132 (MQ=255) tAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCgg < 3:245761/132‑1 (MQ=255) tAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGCTGATGc > 3:469583/1‑149 (MQ=255) ataaatGTTCGTTATCGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCt > 1:300239/5‑124 (MQ=255) ataaatGTTCGTTATCGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCt < 2:300239/120‑1 (MQ=255) atatGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGCTGATGCTg > 4:449332/1‑149 (MQ=255) tGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGCTGATGCTGGAg < 1:53012/149‑1 (MQ=255) cGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTTAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGCTGATGCTGGAGgcgc > 3:527385/1‑149 (MQ=255) | CATGCGTCTCTCTTTCTTTACAAACAAGTGGGCAAATTTACCGCACAGTTTACGTCGAAGCGGCAGATAAACGCCATAATGTTATACATATCACTCTAAAATGTTTTTTCAATGTTACCTAAAGCGCGATTCTTTGCTAATATGTTCGATAACGAACATTTATGAGCTTTAACGAAAGTGAATGAGGGCAGCATGGAAACCAAAGATCTGATTGTGATAGGGGGCGGCATCAATGGTGCTGGTATCGCGGCAGACGCCGCTGGACGCGGTTTATCCGTGCTGATGCTGGAGGCGC > NC_000913/3561821‑3562115 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |