| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,551,422 | T→A | 6.0% | intergenic (‑126/‑214) | gntP ← / → uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,551,422 | 0 | T | A | 6.0% | 350.3 / 8.4 | 99 | intergenic (‑126/‑214) | gntP/uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/51); new base A (2/4); total (44/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATCC > NC_000913/4551274‑4551565 | cAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAt < 1:523762/149‑1 (MQ=255) gagaATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAttt > 3:525547/1‑149 (MQ=255) gaATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTgc < 3:446726/149‑1 (MQ=255) aaTGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTgca < 4:38514/149‑1 (MQ=255) aTGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTgcag < 4:452802/149‑1 (MQ=255) tGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTgcagc > 1:71903/1‑149 (MQ=255) gTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGCTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTgcagca > 1:355156/1‑149 (MQ=255) ttAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGcaa > 2:351627/1‑149 (MQ=255) tAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGTCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaa < 1:375578/149‑2 (MQ=255) tAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaa < 4:526690/149‑2 (MQ=255) aaGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaag < 1:238316/149‑3 (MQ=255) aGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGcaacaa < 3:300470/149‑1 (MQ=255) aGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaagg < 2:71903/149‑4 (MQ=255) gCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCTATTTGCAGCaacaac < 4:594805/149‑1 (MQ=255) gCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATACTCTGATCAATAACTATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCaacaac > 2:413538/1‑149 (MQ=255) acaTGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCa > 1:116559/1‑149 (MQ=255) caTGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCAt < 1:26472/149‑1 (MQ=255) caTGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCAt < 3:393802/149‑1 (MQ=255) aTGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATg > 1:141251/1‑149 (MQ=255) tGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACTATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATga < 1:413538/149‑1 (MQ=255) gCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATgag < 1:587996/149‑1 (MQ=255) cATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATgaga < 4:344312/149‑1 (MQ=255) aTAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGagag > 2:535370/1‑149 (MQ=255) tAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGt < 3:39636/149‑1 (MQ=255) gTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGaaa < 4:62222/149‑1 (MQ=255) ccttacctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTtg < 3:575529/149‑1 (MQ=255) cctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGAtg > 4:302000/1‑149 (MQ=255) ctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGAtgt > 3:486214/1‑149 (MQ=255) ctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGAtgt < 3:420980/149‑1 (MQ=255) tGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGAtgtg < 1:517118/149‑1 (MQ=255) ggTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTgg < 2:210169/149‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAGTTCTTGTGATGTGGTTAACCaa > 3:380575/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCaa < 3:553281/149‑1 (MQ=255) gttgttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAAt < 1:365621/149‑1 (MQ=255) ttgttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAAtt > 3:83071/1‑149 (MQ=255) ttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCa < 3:415068/149‑1 (MQ=255) gATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGtt < 1:99443/149‑1 (MQ=255) gttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACAt > 2:79547/1‑149 (MQ=255) ttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATg > 1:369144/1‑149 (MQ=255) atgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTc > 2:439626/1‑149 (MQ=255) tgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCt < 1:161732/149‑1 (MQ=255) gtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCtt > 2:138870/1‑149 (MQ=255) tAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCtt > 2:57221/1‑148 (MQ=255) tAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCtt < 1:57221/148‑1 (MQ=255) tAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTa < 1:351627/149‑1 (MQ=255) aaaTTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAc < 4:320119/149‑1 (MQ=255) aaaTTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAc < 1:224987/149‑1 (MQ=255) aaTTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAcc > 3:387239/1‑149 (MQ=255) ggTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaaa < 2:47092/149‑1 (MQ=255) ggTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaaa < 1:531660/149‑1 (MQ=255) ggTCAACCATTGTTGCGACGAATGTCACATCCTCTGAACAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCACCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaaa < 2:355156/149‑1 (MQ=255) tCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAgg > 3:259549/1‑149 (MQ=255) tCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAgg > 3:159251/1‑149 (MQ=255) tCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAgg > 1:603572/1‑149 (MQ=255) aaCCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGtt < 3:221587/128‑1 (MQ=255) aaCCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGtt > 4:221587/1‑128 (MQ=255) aCCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAg > 4:152459/1‑149 (MQ=255) aCCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAg > 1:253740/1‑149 (MQ=255) aCCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAg > 1:527336/1‑149 (MQ=255) cATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGaa > 3:75464/1‑149 (MQ=255) cATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGaa > 4:570195/1‑149 (MQ=255) cATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGaa < 2:298671/149‑1 (MQ=255) ttgttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACt > 2:576532/1‑149 (MQ=255) tgttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACtt < 3:99079/149‑1 (MQ=255) gATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGc < 4:594344/149‑1 (MQ=255) gATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGc > 2:15372/1‑149 (MQ=255) gATGAATGTCACATCCTCTCATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATATGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAAACAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGc > 4:390537/1‑149 (MQ=255) tGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCa < 3:476165/149‑1 (MQ=255) aaTGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCAtc < 3:390537/149‑1 (MQ=255) tCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCAt > 4:60466/1‑149 (MQ=255) acaTCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATcc < 4:237841/149‑1 (MQ=255) aTCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTgg < 2:609452/80‑1 (MQ=255) aTCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTgg > 1:609452/1‑80 (MQ=255) aTCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGa < 4:525547/149‑1 (MQ=255) ctctGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATg < 1:584310/54‑1 (MQ=255) ctctGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGc > 2:20987/1‑149 (MQ=255) ctctGATAAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATg > 2:584310/1‑54 (MQ=255) tGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTc > 1:365969/1‑93 (MQ=255) tGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTc < 2:365969/93‑1 (MQ=255) aaTAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAGATTCTTGTCATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAAGTTGTACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCAc < 4:380575/149‑1 (MQ=255) cATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGc > 4:236987/1‑149 (MQ=255) aTCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCg < 1:79547/149‑1 (MQ=255) tCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCgg > 2:69301/1‑149 (MQ=255) tCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCgg > 2:44685/1‑149 (MQ=255) gATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTc < 2:1371/149‑1 (MQ=255) ttACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTg > 1:123251/1‑149 (MQ=255) tACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTgg < 3:570195/149‑1 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCgg < 4:39537/75‑1 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCgg > 3:39537/1‑75 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGt < 4:497434/77‑1 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGt > 3:497434/1‑77 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgtt < 3:302000/149‑1 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgtt < 1:576532/149‑1 (MQ=255) ccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgttg > 1:458094/1‑149 (MQ=255) ccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgttg > 1:415296/1‑149 (MQ=255) cTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgttgt < 1:216590/149‑1 (MQ=255) tttGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgttgtt > 2:32919/1‑149 (MQ=255) tttGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgttgtt < 4:396725/149‑1 (MQ=255) gttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgttgtt > 3:310543/2‑149 (MQ=255) tgcAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATcc < 2:141251/149‑1 (MQ=255) | CAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATCC > NC_000913/4551274‑4551565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |