| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2708671 | 206 (1.100) | 16 (0.090) | 12/224 | NT | 7.6% | coding (84/957 nt) | rseB | anti‑sigma E factor, binds RseA |
| ? | NC_000913 | = 2708691 | 195 (1.110) | coding (64/957 nt) | rseB | anti‑sigma E factor, binds RseA | |||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
CATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGC > NC_000913/2708523‑2708819 | aacaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCggg < 2:836463/149‑1 (MQ=255) aacaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCggg > 1:1690190/1‑149 (MQ=255) aacaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCggg > 4:222646/1‑149 (MQ=255) aacaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCggg > 4:1232551/1‑149 (MQ=255) acaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGa < 3:1232551/149‑1 (MQ=255) ttGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATGACGCCCCGGACGCGGGAGTgg > 4:1372108/1‑149 (MQ=255) ttGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCtcggccactcccgcgt > 3:581785‑M1/1‑133 (MQ=255) ttGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTgg > 3:1121657/1‑149 (MQ=255) cAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAg > 4:1475006‑M2/1‑148 (MQ=255) aaGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAgg < 4:555099‑M2/149‑3 (MQ=255) agagGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCtcggccactcccgcgtccggggc < 3:60294‑M1/149‑24 (MQ=255) gACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgtta > 3:555099‑M2/1‑142 (MQ=255) aCGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCtcggccactcccgcgtccggggcgttat < 4:581785‑M1/149‑29 (MQ=255) ggTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGc > 2:4844/1‑136 (MQ=255) ggTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCa > 2:574170/1‑149 (MQ=255) ttATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGTCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCaga > 4:1094714/1‑149 (MQ=255) ttATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCaga < 1:574170/149‑1 (MQ=255) gtATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCaga > 2:1591820/2‑149 (MQ=255) tCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCggg < 3:784881/125‑1 (MQ=255) gTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCgg < 1:590164/117‑1 (MQ=255) aTGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAgaga > 4:1649121/1‑137 (MQ=255) aTGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAgaga < 3:1649121/137‑1 (MQ=255) aTGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCCCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTAc > 4:161633/1‑149 (MQ=255) gTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCt > 4:1739830/1‑149 (MQ=255) aTAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACa > 4:907393/1‑137 (MQ=255) tAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCAc > 2:193114/1‑149 (MQ=255) gCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACa > 4:1343287/1‑132 (MQ=255) gCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACa < 3:1343287/132‑1 (MQ=255) agagACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgtta < 4:1036072‑M2/117‑8 (MQ=255) agagACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGa > 2:1825249/1‑149 (MQ=255) gaCTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACAt < 3:1372108/149‑1 (MQ=255) aCTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCtcggccactcccgcgtccgggg > 4:1663839‑M1/1‑86 (MQ=255) cTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATgg < 1:1591820/149‑1 (MQ=255) tCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTTATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGt < 4:735006/134‑1 (MQ=255) tCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTTATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGt > 3:735006/1‑134 (MQ=255) tCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGc > 4:144624/1‑149 (MQ=255) cAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGc > 1:1213154/1‑100 (MQ=255) cAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAAc < 1:366491/122‑1 (MQ=255) aaCACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgt > 1:1815450‑M2/1‑102 (MQ=255) aaCACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTaa < 1:1618809/138‑1 (MQ=255) aaCACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGc > 4:594948/1‑147 (MQ=255) aaCACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCaa > 1:844024/1‑149 (MQ=255) acCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCtcggccactcccgcgtccggggcgtt < 3:90871‑M1/105‑27 (MQ=255) ccTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAATAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCaa > 3:302285/1‑149 (MQ=255) cTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGAc > 1:1828310/1‑82 (MQ=255) cTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAgg < 4:827658/118‑1 (MQ=255) cTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAgg > 3:827658/1‑118 (MQ=255) cTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCaaa < 4:960572/149‑1 (MQ=255) cTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCaaa > 3:1670646/1‑149 (MQ=255) cTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCaaa > 2:818217/1‑149 (MQ=255) tGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAg > 2:525025/1‑149 (MQ=255) ttATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgtt > 1:1875763‑M2/1‑92 (MQ=255) ttGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCtt > 2:618693/1‑149 (MQ=255) aTGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACa < 4:781104/106‑1 (MQ=255) tGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACAt > 3:990595/1‑127 (MQ=255) tGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCaaa < 4:694835/138‑1 (MQ=255) tGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGc < 3:1037953/143‑1 (MQ=255) tgatgaATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACt < 3:1829908/149‑1 (MQ=255) tgaatgaCAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCAc < 2:1119599/112‑1 (MQ=255) aatgaCAGCTCGTAATTCAGCGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCaaa < 3:1655960/130‑1 (MQ=255) tgaCAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTg > 2:167137/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCAGCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGt < 1:1007836/149‑1 (MQ=255) tAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTaaa < 3:1450605/149‑1 (MQ=255) tAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTaaa < 2:1761460/149‑1 (MQ=255) ttCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGtt < 2:1690190/149‑1 (MQ=255) gTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGaa < 2:186815/149‑1 (MQ=255) tgactgacTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAAt < 3:348087/149‑1 (MQ=255) tgactgGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCt < 4:114773/149‑1 (MQ=255) tgactgGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCt < 1:525025/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCAc < 4:1697803/149‑1 (MQ=255) ccAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCAc < 3:1715180/147‑1 (MQ=255) aGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGaa < 3:64879/135‑1 (MQ=255) aGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGaa > 4:64879/1‑135 (MQ=255) gTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGa < 3:1551845/132‑1 (MQ=255) tCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAg > 2:1334048/1‑149 (MQ=255) cATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGc < 1:971515/149‑1 (MQ=255) tgctgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCg < 4:465022/111‑1 (MQ=255) tgctgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCg > 3:465022/1‑111 (MQ=255) tgctgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCt > 3:697154/1‑116 (MQ=255) tgctgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCt > 1:1370096/1‑149 (MQ=255) gctgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCtt > 2:736902/1‑149 (MQ=255) tgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGc > 1:313753/1‑149 (MQ=255) tgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGc > 1:6471/1‑149 (MQ=255) gTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCt < 2:313753/149‑1 (MQ=255) taataaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacag < 1:762517‑M2/106‑77 (MQ=255) taataaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCt > 2:917971/1‑126 (MQ=255) ataaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTggg < 2:6471/149‑1 (MQ=255) taaCGCCtcggccactcccgcgtccggggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacagggtgttgagtctct > 3:1036072‑M1/1‑7 (MQ=255) taaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCaaa > 1:242744/1‑80 (MQ=255) taaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTgg > 2:1703978/1‑147 (MQ=255) aCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacagggtgttgagtctctgcgttatcgacatgcacgcctcgataaccgtcct < 1:1727374‑M2/149‑125 (MQ=255) aCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGc > 1:1536741/1‑48 (MQ=255) aCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGc < 2:1536741/48‑1 (MQ=255) cGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTg < 4:714558/149‑1 (MQ=255) gCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGc < 4:1417804/68‑1 (MQ=255) gCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGc > 3:1417804/1‑68 (MQ=255) gCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTgg < 2:262917/143‑1 (MQ=255) ctcggccactcccgcgtccggggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacagggtgttgagtctctgcgttatcgacatgcacgcctcgataaccgtcctcttg > 1:621598‑M1/1‑1 (MQ=255) cccGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGtt > 1:1700276/1‑108 (MQ=255) cccGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTcc > 4:318358/1‑116 (MQ=255) | CATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGC > NC_000913/2708523‑2708819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |