New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 4051999 | 179 (1.010) | intergenic (+143/‑46) | yihI/hemN | activator of Der GTPase/coproporphyrinogen III oxidase, SAM and NAD(P)H dependent, oxygen‑independent |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
ATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTGC‑GC‑AACCGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCGCCGGTACGCCGTAGCCGCCAGAGACGCCATCGGAAGGAGTGAGCATGTCTGTACAGCAAATCGACTGGGATCTGGCCCTGATCCAGAAATATAACTATTCCGGGCCACGATACACCTCGTACCC > NC_000913/4051830‑4052124 | gatgCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTGC‑GC‑AACCGGCtg > 4:956141/1‑148 (MQ=255) gatgCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTGC‑GC‑AACCGGC < 2:1761144‑M1/146‑1 (MQ=255) gTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTGC‑GC‑AACCGGCTGATGAcc < 3:1356735/149‑1 (MQ=255) 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c‑AACCGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCGCCGGTACGCCGTAGCCGCCAGAGACGCCATCGGAAGGAGTGAGCATGTCTGTACAGCAAATCGACTGGGATCTg > 4:1524417/1‑105 (MQ=255) c‑AACCGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCGCCGGTACGCCGTAGCCGCCAGAGACGCCATCGGAAGGAGTGAGCATGTCTGTACAGCAAATCGACTGGGATCTg < 3:1524417/105‑1 (MQ=255) aaCCGGCtgatgacccgaaacgggcatccgccggttgcgcagccacttttgtcgccgcgacaaccgctgtagtttaacgaataaccacaccagataacatataaccggaagggttat > 1:792180‑M1/1‑7 (MQ=255) aaCCGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCGCCGGTACGCCGTAGCCGCCAGAGACGCCATCGGAAGGAGTGAGCATGTCTGTACAGCAAATCGACTGGGATCTGGCCCTGATCCAGAAATATAACTATTCCGGGCCACGATACACCTCg > 2:1236877/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCgccggttgcgcagccacttttgtcgccgcgacaaccgctgtagtttaac > 1:999564‑M2/1‑28 (MQ=255) aCCGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCgccggttgcgcagccacttttgtcgccgcgacaaccgctgtagtttaac < 2:999564‑M2/77‑50 (MQ=255) cGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCGCCGGTACGCCGTAGCCGCCAGAGACGCCATCGGAAGGAGTGAGCATGTCTGTACAGCAAATCGACTGGGATCTGGCCCTGATCCAGAAATATAACTATTCCGGGCCACGATACACCTCGTAc < 1:1236877/149‑1 (MQ=255) ggcggatgcccgtttcgggtcatcagccggttgcgcagccacttttgtcgccgcgacaaccgctgtagtttaacgaataaccacaccagataacatataaccggaagggttatcagcagaacgggaaggcccacggcggcaatccgtta < 2:483785‑M1/149‑147 (MQ=255) gcggatgcccgtttcgggtcatcagccggttgcgcagccacttttgtcgccgcgacaaccgctgtagtttaacgaataaccacaccagataacatataacc < 1:67967‑M1/101‑100 (MQ=255) | ATGATGCGTCTGCTGCGGGGCAACTAACGGATTGCCGCCGTGGGCCTTCCCGTTCTGCTGATAACCCTTCCGGTTATATGTTATCTGGTGTGGTTATTCGTTAAACTACAGCGGTTGTCGCGGCGACAAAAGTGGCTGC‑GC‑AACCGGCTGATGACCCGAAACGGG‑CATCCGCCGGTACGCCGTAGCCGCCAGAGACGCCATCGGAAGGAGTGAGCATGTCTGTACAGCAAATCGACTGGGATCTGGCCCTGATCCAGAAATATAACTATTCCGGGCCACGATACACCTCGTACCC > NC_000913/4051830‑4052124 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |