| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 4625081 | 272 (1.510) | coding (187/969 nt) | serB | 3‑phosphoserine phosphatase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 370 total aligned reads displayed.
TGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCACGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAGCTGGATGTCGCCCCGCTGGGGAAAATCCCG > NC_000913/4624913‑4625209 | tgAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTgg < 3:350073/149‑1 (MQ=255) gAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTggg > 4:1378907/1‑149 (MQ=255) gTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTgg < 2:1398121/142‑1 (MQ=255) tctcTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCaga < 3:230153/132‑1 (MQ=255) tctTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAtcgccgctcccagtttgctct > 4:392889‑M1/1‑128 (MQ=255) tctTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGAt < 2:1511452‑M2/149‑2 (MQ=255) tttATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGAtgg < 2:1475244‑M2/149‑4 (MQ=255) tATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTg < 2:1553589/149‑1 (MQ=255) gCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAtcgccgcacccagtttgctctggtattgg < 3:392889‑M1/149‑30 (MQ=255) gCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAtcgccgcacccagtttgctctggtattgg < 1:41605‑M1/149‑30 (MQ=255) cGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATACACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGAttgtt < 3:158949/149‑1 (MQ=255) cGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGAttgtt < 2:448479/149‑1 (MQ=255) tCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTTTGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGCGCAAACTGGGTGCGGCGAtg < 2:1803372‑M2/136‑3 (MQ=255) tGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTgccgcc > 1:1490219/1‑149 (MQ=255) 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tggtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAtcgccgcacccagtttgctctggtattgg > 4:575813‑M1/1‑96 (MQ=255) gtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTgg < 4:1800648/105‑1 (MQ=255) gtgATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTgg > 3:1800648/1‑105 (MQ=255) tgatgaAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTgcc < 1:1699755/127‑1 (MQ=255) tgaAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAgg < 1:1050106/149‑1 (MQ=255) tgaAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAgg < 2:1183885/149‑1 (MQ=255) 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aaTACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCACGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAGCTGGATGTCGCCCCGCTGGGGaaa > 1:1001247/1‑149 (MQ=255) aTACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCACGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAGCTGGATGTCGCCCCGCTGGGGaaaa < 2:984319/149‑1 (MQ=255) aCCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCACGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAGCTGGATGTCGCCCCGCTGGGGAAAATc < 2:1260559/149‑1 (MQ=255) cAtcgccgcacccagtttgctctggtattgggtcagacgttgtttatccagcccacgaccatacagcagccagccgctacgacctgcgtggtaatccagtggcatcacttcatcaccacttaatgaaagaggcagacccggccataaag < 1:146171‑M1/149‑148 (MQ=255) cAtcgccgcacccagtttgctctggtattgggtcagacgttgtttatccagcccacgaccatacagcagccagccgctacgacctgcgtggtaatccagtg < 1:928774‑M1/101‑100 (MQ=255) cAtcgccgcacccagtttgctctggtattgggtcagacgttgtttatccagcccacgaccatacagcagccagccgctacgacctgcgtggtaatccagtg > 2:928774‑M1/1‑2 (MQ=255) cAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCACGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAGCTGGATGTCGcccc < 2:201576/134‑1 (MQ=255) cAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCACGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAGCTGGATGTCGCCCCGCTGGGGAAAATccc < 2:1855341/149‑1 (MQ=255) atcgccgcacccagtttgctctggtattgggtcagacgttgtttatccagcccacgaccatacagcagccagccgctacgacctgcgtggtaatccagtggcatcacttcatcaccacttaatgaaagaggcagacccggccataaaga < 3:1830364‑M1/149‑149 (MQ=255) atcgccgcacccagtttgctctggtattgggtcagacgttgtttatccagcccacgaccatacagcagccagccgctacgacctgcgtg < 1:1441424‑M1/89‑89 (MQ=255) atcgccgcaccaagtttgctctggtattggttcatacgttgtttatccagcccacgtccatacagcagccagccgctacgacctgcgtggtaatccagtcgcatcccctcatcaccacttaatgaaagaggcagacccggccataaaga < 4:1170574‑M1/149‑149 (MQ=255) | TGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCACGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAGCTGGATGTCGCCCCGCTGGGGAAAATCCCG > NC_000913/4624913‑4625209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |