| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,286,142 | T→A | 8.8% | intergenic (+6/‑69) | yejM → / → proL | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor/tRNA‑Pro |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,286,142 | 0 | T | A | 8.8% | 313.0 / 17.0 | 91 | intergenic (+6/‑69) | yejM/proL | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor/tRNA‑Pro |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/44); new base A (3/5); total (42/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CCCGAAAAAGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGT > NC_000913/2285995‑2286279 | cccGAAAAAGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGattaatta > 3:1657286/1‑149 (MQ=255) ccGAAAAAGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATtat < 1:1741487/149‑1 (MQ=255) aaaGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATc > 3:1581256/1‑149 (MQ=255) aaGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCa < 4:461425/149‑1 (MQ=255) gACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGt > 4:201771/1‑149 (MQ=255) gACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGt < 3:947508/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTa < 1:1744449/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTa < 3:1368968/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTa < 4:1581256/149‑1 (MQ=255) gCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAg < 4:1657286/149‑1 (MQ=255) gTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTa > 1:89334/1‑144 (MQ=255) gTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTa < 2:89334/144‑1 (MQ=255) aCTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAat < 3:591675/149‑1 (MQ=255) tGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGt > 3:39649/1‑138 (MQ=255) tGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGt < 4:39649/138‑1 (MQ=255) tGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAatat > 2:481796/1‑149 (MQ=255) cAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTa > 2:160956/1‑149 (MQ=255) cAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTCGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACACTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCTAAATATCTTa < 3:1167555/149‑1 (MQ=255) tAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACtt < 3:201771/149‑1 (MQ=255) gTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGattaatta > 2:470676/1‑117 (MQ=255) tAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCa > 1:377498/1‑123 (MQ=255) tAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCa < 2:377498/123‑1 (MQ=255) ccGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGt < 4:1479921/119‑1 (MQ=255) aCTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGaaa > 3:458551/1‑149 (MQ=255) aCAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACgg > 2:1197849/1‑149 (MQ=255) aaCTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTa < 3:1368501/124‑1 (MQ=255) aaCTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTa > 4:1368501/1‑124 (MQ=255) aCTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgtag < 1:160956/149‑1 (MQ=255) ttACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAat > 2:1483072/1‑115 (MQ=255) ttACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAat < 1:1483072/115‑1 (MQ=255) ttACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgtagta < 1:1197849/149‑1 (MQ=255) gtggtgAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgta < 1:1663461/142‑1 (MQ=255) gtggtgAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgta > 2:1663461/1‑142 (MQ=255) gtggtgAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgta > 2:1273977/1‑142 (MQ=255) gtggtgAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTag < 1:481796/149‑1 (MQ=255) gtggtgAAAGAGTGAAAGATGAAAAAACACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgta < 1:1273977/142‑1 (MQ=255) gaaagagtgaaagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGcc > 3:1849893/1‑149 (MQ=255) aagagtgaaagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCAc > 3:1863672/1‑149 (MQ=255) agagtgaaagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGaaaa > 1:714575/1‑129 (MQ=255) agagtgaaagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGaaaa < 2:714575/129‑1 (MQ=255) tgaaagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTAt < 1:815804/134‑1 (MQ=255) tgaaagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTAt > 2:815804/1‑134 (MQ=255) aaagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCgg > 1:182974/1‑149 (MQ=255) aagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTa > 3:1109863/1‑133 (MQ=255) aagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTa < 4:1109863/133‑1 (MQ=255) gaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgt > 1:566159/1‑124 (MQ=255) gaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgt < 2:566159/124‑1 (MQ=255) aaaaCCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAg < 3:1247177/83‑1 (MQ=255) aaaCCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCTGCACGTAgcg > 1:1095236/1‑149 (MQ=255) ccACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGgt > 1:360600/1‑103 (MQ=255) ccACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGgt < 2:360600/103‑1 (MQ=255) ccACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAg < 1:272573/149‑1 (MQ=255) acaGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgt > 4:1121406/1‑113 (MQ=255) acaGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGgt < 3:1121406/113‑1 (MQ=255) aGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTg > 2:1161271/1‑149 (MQ=255) aGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTg > 2:1254850/1‑149 (MQ=255) aGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTg > 4:1638825/1‑149 (MQ=255) gTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGaaa > 1:59434/1‑79 (MQ=255) gTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGaaa < 2:59434/79‑1 (MQ=255) gTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTAt < 3:1536940/115‑1 (MQ=255) gTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTAt > 4:1536940/1‑115 (MQ=255) ttAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGTAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGt > 4:128449/1‑149 (MQ=255) tttGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAgcgc > 3:1657903/1‑149 (MQ=255) gTTATTGCAAGTACTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCAcc < 2:1095236/149‑1 (MQ=255) aTTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTc > 1:1732029/1‑118 (MQ=255) aTTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTc < 2:1732029/118‑1 (MQ=255) aaGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGTAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg < 3:128449/149‑1 (MQ=255) aaGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg < 4:1849893/149‑1 (MQ=255) aaGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg < 1:1161271/149‑1 (MQ=255) aaGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg > 4:934093/1‑149 (MQ=255) aaGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg < 3:1638825/149‑1 (MQ=255) aaGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg < 1:1254850/149‑1 (MQ=255) gTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTc > 1:517818/1‑111 (MQ=255) gTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTc < 2:517818/111‑1 (MQ=255) gACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCgg < 4:1657903/149‑1 (MQ=255) cAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCgggg < 4:458551/149‑1 (MQ=255) aGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATgg < 4:574605/138‑1 (MQ=255) aGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATgg > 3:574605/1‑138 (MQ=255) aCGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTTATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGc < 1:117260/104‑1 (MQ=255) aCGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGc > 4:789007/1‑104 (MQ=255) aCGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGc < 3:789007/104‑1 (MQ=255) aCGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGc > 2:117260/1‑104 (MQ=255) aaGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAgg < 4:1863672/149‑1 (MQ=255) tATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATc < 3:934093/149‑1 (MQ=255) aaCTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGt > 1:1169834/1‑149 (MQ=255) aCTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAgg > 1:1187513/1‑133 (MQ=255) aCTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAgg < 2:1187513/133‑1 (MQ=255) aCTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATgg > 1:549662/1‑115 (MQ=255) aCTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATgg < 2:549662/115‑1 (MQ=255) tGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAgc < 3:943224/101‑1 (MQ=255) tGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAgc > 4:943224/1‑101 (MQ=255) ttaattaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGa < 3:957188/72‑1 (MQ=255) ttaattaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg > 4:1451664/1‑111 (MQ=255) ttaattaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATggg < 3:1451664/111‑1 (MQ=255) ttaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGa < 3:214379/68‑1 (MQ=255) ttaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGa > 4:214379/1‑68 (MQ=255) ttaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTg > 1:1626799/1‑89 (MQ=255) ttaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTg < 2:1626799/89‑1 (MQ=255) ttaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGt < 1:448434/139‑1 (MQ=255) ttaTAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGt > 2:448434/1‑139 (MQ=255) | CCCGAAAAAGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGT > NC_000913/2285995‑2286279 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |