| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,202,686 | C→T | 7.0% | L266F (CTC→TTC) | cca → | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,202,686 | 0 | C | T | 7.0% | 417.1 / 15.5 | 129 | L266F (CTC→TTC) | cca | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (53/67); new base T (5/4); total (58/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.30e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAAT > NC_000913/3202541‑3202828 | ggCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActct < 1:1623848/149‑1 (MQ=255)ggCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActct < 1:70221/149‑1 (MQ=255)ggCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActct < 2:383462/149‑1 (MQ=255)ggCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActct > 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cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTc > 2:1198053/1‑149 (MQ=255) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTc < 4:160898/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTc > 3:160898/1‑149 (MQ=255) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTc < 1:1198053/149‑1 (MQ=255) gcggccAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGc > 4:424901/4‑108 (MQ=255) gcggccAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGc < 3:424901/105‑1 (MQ=255) ccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATc > 4:1771600/1‑135 (MQ=255) ccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATc < 3:1771600/135‑1 (MQ=255) ccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAAt > 4:300104/1‑149 (MQ=255) | GGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAAT > NC_000913/3202541‑3202828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |