| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 374,689 | A→G | 7.1% | R274R (CGA→CGG) ‡ | mhpE → | 4‑hyroxy‑2‑oxovalerate/4‑hydroxy‑2‑oxopentanoic acid aldolase, class I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 374,689 | 0 | A | G | 7.1% | 508.1 / 19.2 | 153 | R274R (CGA→CGG) ‡ | mhpE | 4‑hyroxy‑2‑oxovalerate/4‑hydroxy‑2‑oxopentanoic acid aldolase, class I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (73/69); new base G (5/6); total (78/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAG > NC_000913/374541‑374836 | cgGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGa < 2:256650/149‑1 (MQ=255) gAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTc < 4:1670891/149‑1 (MQ=255) gggcgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATc < 1:1561645/149‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctg < 1:1775129/149‑1 (MQ=255) ggTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggc < 1:1705759/149‑1 (MQ=255) gTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATc < 3:379062/135‑1 (MQ=255) gTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATc < 3:646451/135‑1 (MQ=255) gTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATc > 4:646451/1‑135 (MQ=255) aCGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGCCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcgctg < 4:7535/149‑1 (MQ=255) gCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTggg > 2:230881/1‑149 (MQ=255) aaGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGgt > 2:1789105/1‑149 (MQ=255) gtgtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGgtgt < 1:1789105/149‑1 (MQ=255) tgtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGtt > 1:642095/1‑149 (MQ=255) gtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcgctgg > 2:301420/1‑134 (MQ=255) gtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcgctgg < 1:301420/134‑1 (MQ=255) tttATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACTCGTACCGGTCGATcct > 2:481434/1‑115 (MQ=255) tttATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACTCGTACCGGTCGATcct < 1:481434/117‑3 (MQ=255) tATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcgctg > 4:1026719/1‑130 (MQ=255) tgtcgccgcGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGa < 2:327320/146‑1 (MQ=255) gccgccGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACTCGTACCGGTCGATcct > 2:1339396/1‑109 (MQ=255) ccgccgCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGc < 3:257230/149‑1 (MQ=255) ccgcGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTc > 3:767499/1‑149 (MQ=255) gATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCg > 1:1667029/1‑149 (MQ=255) aTAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGt < 4:494134/149‑1 (MQ=255) aaaCTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGgt > 4:722024/1‑126 (MQ=255) aaaCTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCa > 1:357105/1‑149 (MQ=255) aCTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGc > 1:974020/1‑136 (MQ=255) aCTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGc < 2:974020/136‑1 (MQ=255) tGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGc < 1:1388962/141‑1 (MQ=255) tGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGc > 2:1388962/1‑141 (MQ=255) cTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGaaa < 1:230881/149‑1 (MQ=255) tGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTc > 4:1033134/1‑139 (MQ=255) tGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTc < 3:1033134/139‑1 (MQ=255) tGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAAc > 1:1131137/1‑149 (MQ=255) gACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGgcgc > 1:1267784/1‑149 (MQ=255) gACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGgcgc < 3:574639/149‑1 (MQ=255) cGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctg > 4:1106458/1‑85 (MQ=255) cGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctg < 3:1106458/85‑1 (MQ=255) cGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGtt > 1:1442373/1‑149 (MQ=255) gATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACtg > 4:298153/1‑128 (MQ=255) gATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACtg < 3:298153/128‑1 (MQ=255) gATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTa < 2:1764392/149‑1 (MQ=255) tctcTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATg < 1:755071/149‑1 (MQ=255) tctcTATGCGTGAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATg > 3:1083602/1‑149 (MQ=255) tctATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGc > 1:1393069/1‑149 (MQ=255) tctATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGc > 1:1444657/1‑149 (MQ=255) tATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCtt < 1:1746251/149‑1 (MQ=255) aTGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTa > 1:1601912/1‑149 (MQ=255) tGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTaa < 2:1393069/149‑1 (MQ=255) cGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGt < 4:767499/149‑1 (MQ=255) gTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGaaa < 2:677570/122‑1 (MQ=255) ttAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAAcggc < 4:337865/125‑1 (MQ=255) ttAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAAcggc > 3:337865/1‑125 (MQ=255) aTGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGt < 2:1267784/149‑1 (MQ=255) tGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTg < 4:1083602/149‑1 (MQ=255) ggATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGaaa < 1:775687/116‑1 (MQ=255) ggATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGaaa > 2:775687/1‑116 (MQ=255) ggATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTgg > 3:499768/1‑149 (MQ=255) cgccgACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTc > 4:1062767/1‑94 (MQ=255) ccgACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATtctc < 1:489619/149‑1 (MQ=255) acgacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGtt < 1:1057086/149‑1 (MQ=255) gacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATgg < 3:869647/122‑1 (MQ=255) gacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGa > 2:1079315/1‑149 (MQ=255) gacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGa < 2:1444657/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGc < 2:357105/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCt > 3:104347/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTa < 1:495582/73‑1 (MQ=255) tGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTa > 4:1847844/1‑73 (MQ=255) tGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTa > 2:495582/1‑73 (MQ=255) tGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCAGGTGTTTa < 3:1847844/73‑1 (MQ=255) gTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTggg < 2:1601912/149‑1 (MQ=255) gCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGt > 2:1573053/1‑138 (MQ=255) gTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCt < 2:900459/79‑1 (MQ=255) gTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCt > 1:900459/1‑79 (MQ=255) gTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAGGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGc < 4:1533255/146‑1 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGgcggcggcgtt < 3:1459561/105‑3 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGgcggcggcgtt > 4:1459561/1‑103 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGgcggcggcgtt < 1:399273/105‑3 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTgg > 3:1812331/1‑143 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTgg < 4:1812331/143‑1 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAAc > 1:1081009/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGcc > 4:910116/1‑149 (MQ=255) gCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCCCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGATTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCCTTGAGCTGGGCATACGCCGGa > 3:1174401/1‑149 (MQ=255) cAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGAt < 4:499768/149‑1 (MQ=255) ggATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGtt < 3:1588822/98‑1 (MQ=255) ggATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATgg > 1:1696322/1‑149 (MQ=255) gATCGACTCGTACCGGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGt < 2:679691/125‑1 (MQ=255) gATCGACTCGTACCGGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGt > 1:679691/1‑125 (MQ=255) gATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGgcgc < 2:623296/94‑1 (MQ=255) gATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCtt > 1:818752/1‑104 (MQ=255) gATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGt > 4:1575228/1‑149 (MQ=255) aTCGACTCGTACCGGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAAc < 2:1122976/138‑1 (MQ=255) aTCGACCGGTACGAGTCGATCGCGATTCGTTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGTGCTGCCTGCGTCACGGTGAAGCGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGTATATAGTCGTCGATCTGGGCAAACGCCGGATGGtt < 4:1174401/149‑1 (MQ=255) gACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTggc < 2:361265/149‑1 (MQ=255) gACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTggc > 1:1514183/1‑149 (MQ=255) gTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGata < 3:1265567/109‑1 (MQ=255) gTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGata > 4:1265567/1‑109 (MQ=255) gTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCa > 3:1727023/1‑149 (MQ=255) cGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCagga < 2:76942/149‑1 (MQ=255) gAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCaggag > 1:341085/1‑149 (MQ=255) | CGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAG > NC_000913/374541‑374836 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |