| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,563,539 | 0 | T | C | 6.9% | 659.6 / 26.2 | 201 | intergenic (+21/+248) | glpD/yzgL | sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding/pseudogene, periplasmic solute binding protein homology |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (94/93); new base C (6/8); total (100/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.83e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
CGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAA > NC_000913/3563396‑3563687 | cgcgccgACGACGCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGAt < 1:718818/149‑1 (MQ=255) acgCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTgg < 2:383893/149‑1 (MQ=255) gCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGcc > 1:340830/1‑149 (MQ=255) gCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGCCAGATTGAAATCTGAcc 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ttAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTa < 1:1429953/129‑1 (MQ=255) tAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGt < 4:476846/149‑1 (MQ=255) gTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 2:1261857/1‑89 (MQ=255) gTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg < 1:1261857/89‑1 (MQ=255) gTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATGCGACGTGAACGTctta > 3:891757/1‑146 (MQ=25) gTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCa > 1:1319111/1‑149 (MQ=255) tGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTg > 2:1839024/1‑116 (MQ=255) aTCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCa > 2:1878337/1‑148 (MQ=255) aTCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCa < 1:1878337/148‑1 (MQ=255) tCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGAc > 1:1832778/1‑128 (MQ=255) gTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATaa > 3:6835/1‑121 (MQ=255) gTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACa > 3:909103/1‑149 (MQ=255) tCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACaa > 1:1779089/1‑149 (MQ=255) | CGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAA > NC_000913/3563396‑3563687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |