Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,563,554 | 0 | G | A | 5.6% | 657.3 / 18.8 | 196 | intergenic (+36/+233) | glpD/yzgL | sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding/pseudogene, periplasmic solute binding protein homology |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (94/91); new base A (4/7); total (98/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.37e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
ACGCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAAAGCGCACTTTGTCA > NC_000913/3563406‑3563701 | ccccTGTCGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCAGATCAACAATGTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGGATACGCAACAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAATGTGATCAGGTCACATTTCAATGTGGcc < 2:1353196/148‑1 (MQ=255) cTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTga < 1:1077024/149‑1 (MQ=255) cTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTga > 3:1683679/1‑149 (MQ=255) 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gccAGATTGAAATCTGACCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTc > 3:956668/3‑133 (MQ=255) gccAGATTGAAATCTGACCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTc < 4:366305/131‑1 (MQ=255) tCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTAt > 2:1115187/1‑81 (MQ=255) cAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACaaa < 1:1735574/149‑1 (MQ=255) gATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAAAgc < 4:909103/149‑1 (MQ=255) tttCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATaa < 4:576360/115‑1 (MQ=255) tCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAAAGCGCACTTTg < 2:930126/149‑1 (MQ=255) ggCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAAAgcg > 2:787532/1‑139 (MQ=255) ggCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAAAgcg < 1:787532/139‑1 (MQ=255) | ACGCCCTGTGGCGTCGCACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGATCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATAAGACGTTCACGTCGCATCCGGCATGAACAAAGCGCACTTTGTCA > NC_000913/3563406‑3563701 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |