New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 459 total aligned reads displayed.
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cGAATACATTCCGTTCCCGGATAAACTGAAAGGCCGCTATCAGGCGTTCACTCAGGCAGATCTGACAAATCGGCGTGCGGCGGGTTACGACAAACCGTTCAAAACCGTTGCTGAAGGTGTAACGGAATACATGGCCTGGCTGAATCGCGACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCC‑CGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATgg < 2:438871/275‑1 (MQ=255) ttCCGTTCCCGGATAAACTGAAAGGCCGCTATCAGGCGTTCACTCAGGCAGATCTGACAAATCTGCGCGCGGCGGGTTACGACAAACCGTTCAAAACCGTTGCTGAAGGTGTAACGGAATACATGGCCTGGCTGAATCGCGACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCC‑CGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTCTCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCa > 2:498393/1‑275 (MQ=255) tCCGTTCCCGGATAAACTGAAAGGCCGCTATCAGGCGTTCACTCAGGCAGATCTGACAAATCTGCGCGCGGCGGGTTACGACAAACCGTTCAAAACCGTTGCTGAAGGTGTCACGGAATACATGGCCTGGCTGAATCCCGACGCGTAAGCGCTCCGCATGAAAATACCGGTGAGCGGCC‑CGGCCTGGGTTGGCGCCATGATGATGTCGCTAAGTCTCCACCGCCCGCCTCAGGCGGCCTTTCCCCCCGCGCTAATCGAGGTGACGGccaggccat > 4:71270/1‑267 (MQ=255) tCCCGGATAAACTGAAAGGCCGCTATCAGGCGTTCACTCAGGCAGAGCTGACAAATCTGCGCGCGGCGGGTTACGACAAACCGTTCAAAACCGTTGCTGAAGGTGTAACGGAATACATGGCCTGGCTGAATCGCGACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCC‑CGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGc < 1:9902/275‑1 (MQ=255) cccGGATAAACTGAAAGGCCGCTATCAGGCTTTCACTCAGGCAGATCTGACAAATCTGCGCGCGGCGGGTTACGACAAACCGTTCAAAACCGTTGCTGAAGGTGTAACGGAATACATGGCCTGGCTGAATCGCGACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGTCC‑CGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGcc < 2:24768/275‑1 (MQ=255) cTATCAGGCGTTCACTCAGGCAGATCTGACAAATCTGCGCGCGGCGGGTTACGACAAACCGTTCAAAACCGTTGCTGAAGGTGTAACGGAATACATGGCCTGGCTGAATCGCGACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCC‑CGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATTGTGCCGTCCATTATTATCGCGGGTGc > 2:58494/1‑275 (MQ=255) 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tATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCGCGGCgaga > 1:117686/1‑274 (MQ=255) aTCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgccgc > 6:293764/1‑149 (MQ=255) cGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGc > 7:361834/1‑138 (MQ=255) cACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCTGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAAc < 6:214272/149‑1 (MQ=255) aCGTTCCAGGCGGGCTATCCCCAGGCGTTAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCGCGGCGAGATGCGCt < 2:334806/274‑1 (MQ=255) aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGACCGCTGGAAATCGACGAAAACCGCAAACTGGGGCATAGCCCGCGGGACAAGAGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACGCCATCAAACCTGCCTTATTGCCCTTCTTAGCGGGTATTCCTCATCGCACGTGCTGGCcaggcgcgtggcgcca > 4:383406/1‑265 (MQ=255) tCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCa > 4:132063/1‑141 (MQ=255) tCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGt > 8:130391/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATa < 5:293764/149‑1 (MQ=255) gcgggcTATCCCCAGGGGATAATCGATTGGAGGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATGGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCGCGGCGAGATGCGCTACGGTTTACt < 4:103759/275‑1 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGt > 3:72406/1‑72 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCGCGGCGGGATGCGCTACGGTTTACTCAACg > 2:284360/1‑275 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCCCGGCGAGATGCGCTACGGTTTACTCAACg > 2:79233/1‑275 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGACCGCTGGAAATCGGCGAACTCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGCAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTAAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGTTATTCCCCACCGCACCGGCTGCCGCGGCGTGATGCCCCTCGGTTTTCTCAACg > 4:346842/1‑275 (MQ=255) cTATCCCCAGACGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCACACTGGGTCATAGCCTGTGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCATTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCGGACGCGGCGACATGCGCTACGGTTTTCTCACCg > 1:67752/1‑275 (MQ=255) aTCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGt < 5:242648/149‑1 (MQ=255) aTCCCCAGCGGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATCATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGACTCTCGGTCAAGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCGCGGCGAGATGCGCTACGGTTTACTCAACGAt < 2:190588/275‑1 (MQ=255) cccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGTAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGACATAGCCTGCGTGaa > 5:61572/1‑149 (MQ=255) cccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaa > 5:461653/1‑149 (MQ=255) ggCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGt > 2:17795/1‑142 (MQ=255) gCGATAATaatggacggcaccatgccggtgccatcacatcgattatcgcctggggatagcgcgcctggagcgtgcgatagagactttgcgacatgatgatgtcgcaaa > 8:10864‑M1/1‑8 (MQ=255) gCGATAATaatggacggcaccatgccggtgccatcacatcgattatcgcctggggatagcgcgcctggagcgtgcgatagagactttgcgacatcatcatgtcgccaacccaagacgggccgatcaccagtattttcatgcagagctcttatgcgtcgcgattcagccaggccatgtattccgttacaccttcagcaacggttttgaacggtttgtcgtaacccgccgcgcgcagatttgtcagatctgcctgagtgaacgcctgatagcggcct < 2:159372‑M1/275‑268 (MQ=255) gATAATaatggacggcaccatgccggtgccatcacatcgattatcgcctggggatagcgcgcctggagcgtgcgatagagactttgcgacatcatcatgtcgccaacccaagacgggccgatcaccagtattttcatgcagagctctta > 6:370909‑M1/1‑6 (MQ=255) gATAATCGATGTGGTGGCACCGGCATGTTGCCCTCCATTATTAGCGCGGATGCCGGAAGTTAACGACGCTATTCCTAGGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCGAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCGCGGCGAGATGCGCTACGGTTTACTCAACGATGTACGCGTg < 1:45656/274‑1 (MQ=255) gATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCt < 8:452915/149‑1 (MQ=255) aTAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAACCTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAg > 4:29463/1‑144 (MQ=255) aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTattatcgcctggggatagcgcgcctggagcgtgcgatagagactttgcgacatcatcatgtcgccaacccaagacgggccgatcaccagtattttcatgcagagctcttatgc < 5:376763‑M2/149‑114 (MQ=255) aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAACCTGCGTGAAAAACGCTACGACCGCGGCTACGCCTTACCCAACTCCTTCAAATCTTCATTAGGGCCTTTCTTCGCGGGTCTTCCCTATCCCATCGGCTGGACCGTCGAGATGCCTCACGGTTTTCTCCACGCTGTCcgcccct > 4:242999/1‑268 (MQ=255) taatggacggcaccatgccggtgccatcacatcgattatcgcctggggatagcgcgcctggagcgtgcgatagagactttgcgacatcatcatgtcgccaacccaagacgggccgatcaccagtattttcatgcagagctcttatgcgt < 6:75311‑M1/149‑149 (MQ=255) | AGGCCAGATCGAATACATTCCGTTCCCGGATAAACTGAAAGGCCGCTATCAGGCGTTCACTCAGGCAGATCTGACAAATCTGCGCGCGGCGGGTTACGACAAACCGTTCAAAACCGTTGCTGAAGGTGTAACGGAATACATGGCCTGGCTGAATCGCGACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCC‑CGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTCGCGGGTATTCCTCATCGCACCGGCTGGCGCGGCGAGATGCGCTACGGTTTACTCAACGATGTACGCGTGCTC > NC_000913/3794754‑3795297 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |