| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,288,033 | 0 | T | G | 10.7% | 311.6 / 27.5 | 104 | intergenic (+23/‑57) | yraH/yraI | putative fimbrial‑like adhesin protein/putative periplasmic pilin chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/52); new base G (6/5); total (47/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.34e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTG‑AC‑CTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCAGGAGGAATCGTTTTACAGCGAACGCGAGTGATCTATGATGCCAGCCGCAAAGAGGCTGCGTTACCTGTCGCAAACAAAGGCGCAGAAACGCCTTATTTACTGCAATCATGGGTAGATAATATAGATGGTAAAAGCCGTGCCCCAT > NC_000913/3287777‑3288303 | tttGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTG‑AC‑CTGTCAGATAACGCCCtttt > 2:322008/1‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |