| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,482,229 | A→T | 5.5% | intergenic (+28/+26) | ynbD → / ← azoR | putative phosphatase inner membrane protein/NADH‑azoreductase, FMN‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,482,229 | 0 | A | T | 5.5% | 378.1 / 9.6 | 110 | intergenic (+28/+26) | ynbD/azoR | putative phosphatase inner membrane protein/NADH‑azoreductase, FMN‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/46); new base T (3/3); total (60/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.20e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CCGGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCA‑TCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCTTTTTTACCCGTTACCAGACCTTCCGGACCGTTCT > NC_000913/1481956‑1482493 | ccGGAAGGGGGGGAGGGCCGACGTGCCGGGGCGATGCTGGAAACAGTACGCGAAGGGAAAGGAGGGGTTCTGGTCGATTGTGCATTGTGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGGGGCGGCATGGTTGTGATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTa < 4:267356/274‑1 (MQ=255) agagGGGGAGCTCAGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTc < 2:418666/274‑1 (MQ=255) agagGGGGAGATCCGACAGGCCGTGGGGATGCTGGAAACATTACGGGAAGAGCAAGGCAGCGTTATGGTCCAATGTGGATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCGGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCTATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCACGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTc < 4:50683/274‑1 (MQ=255) ggggAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACAt > 2:51138/1‑275 (MQ=255) aGGCCGTGGCGCGTCTGGAAACATTACGCGCAGAGCAGGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATCGGTATTATCGCGCAGTGCGCTGGGGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACCCTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTc < 2:428385/274‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGAAGATTGTGCTGACAAACGAGCACAAAGCGAGGCTGGAATTTGGGGAAAACCGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACGGAATATCTACCGGCCAAAACAAAAACGTGTccc > 4:196116/1‑274 (MQ=255) gTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCATCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCa < 2:196118/259‑1 (MQ=255) cGATGCTGAAAACATTACGCGGAGGGCAAGGCAGGGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGAGTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAGGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCa < 2:61906/275‑1 (MQ=255) tgtgCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCCCAAAGCGATGCTGAGATGATGGGAAAACAGGTATGTGGAATGAGATGTGGACGGAATTTCTAACGTCCACATACAAACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCGTGCAAGTGCCGCTTTTGGTTCAAACTGTTCtttac > 4:465880/1‑272 (MQ=255) tgCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCt < 2:239316/274‑1 (MQ=255) cATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGGTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGc < 1:89627/274‑1 (MQ=255) gtggCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTAc > 4:546963/1‑164 (MQ=255) cggcATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTc < 2:546968/164‑1 (MQ=255) gttatgttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTa < 7:71328/149‑1 (MQ=255) atgttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGAGTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAg > 7:359234/1‑149 (MQ=255) ttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTcc > 8:127580/1‑149 (MQ=255) aCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTa > 2:217326/1‑275 (MQ=255) cGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCcaca < 7:341353/149‑1 (MQ=255) cacTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCaa < 7:245275/149‑1 (MQ=255) tGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATctcaat < 5:100554/149‑6 (MQ=39) gTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGAcc < 7:326048/149‑1 (MQ=255) gTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCgg < 6:218226/149‑1 (MQ=255) ttAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGCTTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATATACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGATTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTCATGCCGATAAAGCCGAgg > 1:57103/1‑275 (MQ=255) ttAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTTAAATGTGGACGGAATAACAACAGCCCACATCAAGACCGTATCCGGGTATGAAGAAAAAATGCTCTAGATGGCGGATTTTGCGTCAGACTGTTCTGTGCCTGCCATTTCCGGACCAGGTGCGATCCCTTCCGCGAAGACCANNNTCCCATTGGTACTGGCGAGAAAGACGAga > 3:154932/1‑274 (MQ=255) ttAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTAc > 4:142548/1‑124 (MQ=255) ttAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGANCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGGCGATGGCTGCTTTTGCGTCCGAATGTGCTTTCGCTGCCCTTTCCGNACCGTTTGCGTCTCCTTCGGCGAAGACAAANNTCACATCGGCCATGCCACTAAAGcccgtg > 3:70431/1‑271 (MQ=255) ttAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct > 3:80202/1‑176 (MQ=255) ttAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGc > 2:388057/1‑184 (MQ=255) ttAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGTGAAGCCAAATTTCACACAGGTAATGCCGTAAAAGCCGAgg > 4:237410/1‑275 (MQ=255) tGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCtt < 1:80202/176‑1 (MQ=255) gAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGc > 7:73420/1‑149 (MQ=255) aaGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCa > 6:50293/1‑149 (MQ=255) aaGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCa > 6:1493/1‑149 (MQ=255) aaGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCa < 5:129287/149‑1 (MQ=255) tggCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATACCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGAt < 1:70431/273‑1 (MQ=255) aGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAAt < 5:420966/149‑1 (MQ=255) tataTTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCt < 7:381286/149‑1 (MQ=255) tataTTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCt < 5:191461/149‑1 (MQ=255) tataTTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTCAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCt < 5:372848/149‑1 (MQ=255) atTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTc > 5:73557/1‑149 (MQ=255) atTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGAGTCAGACTGTGCTTTCg > 4:497331/1‑181 (MQ=255) ttCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATc > 6:416311/1‑113 (MQ=39) ttCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATc < 5:416311/113‑1 (MQ=38) gAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGc < 2:497336/181‑1 (MQ=255) gCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgc > 8:456034/1‑149 (MQ=255) gCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCg > 4:297612/1‑175 (MQ=255) gACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGc < 2:297616/175‑1 (MQ=255) gACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCAAAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAc < 2:357050/161‑1 (MQ=255) aCGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAAc > 3:98106/1‑129 (MQ=255) gCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCtttt < 7:61439/149‑1 (MQ=255) cctcAGATTGTGCTGACAGAAGAACACAAAGTGATGATGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGAATGAGATGTGGCCTGAATATCTACAGTCCACACCAAGATCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGTTGCTTTTGc < 6:166496/146‑1 (MQ=255) ccGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATg < 1:98106/129‑1 (MQ=255) tgCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGGTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGTCCGTTTGCGAACCCTCCGGCGAAGGCAAATTTCAAATCGGAACTCCCGAAAAAGCCGAGGAACGTGGAAAGTANNNGACTCACCCGGGCTGTAGGTTCC‑TCttt > 3:137628/1‑274 (MQ=255) tgCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGGTACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCA‑TCTTtg > 2:383263/1‑275 (MQ=255) tGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCt > 5:120555/1‑149 (MQ=255) gACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCtt > 5:186064/1‑149 (MQ=255) aCAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCcac < 6:428912/81‑1 (MQ=37) aCAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCcac > 5:428912/1‑81 (MQ=37) cAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAAtt > 1:25429/1‑195 (MQ=255) aGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACGGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCg > 5:157519/1‑149 (MQ=255) aGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCg > 7:232118/1‑149 (MQ=255) cgggCACAAAGCGATGCGGAGATTAGGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGNATGAATNTCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTcac < 3:25429/192‑1 (MQ=255) acaAAGCGATGCTGATATTATGGGAAAAAAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATTTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCA‑TCTTTGTGGATCCCGCcgcg < 1:154932/274‑1 (MQ=255) aaaaaGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGGGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCA‑TCTTTGTGGATCCCGCCGCgg < 2:237414/273‑1 (MQ=255) aaaaaGAGATTGTGAGAATATGGGAAAACAGGTAAGGTGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCA‑TCTTTGTGGATCCCGCcgcg < 4:383258/272‑1 (MQ=255) tGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct > 4:266908/1‑107 (MQ=255) tGCTGAGATTACGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCCACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGACACAATGCTGTCGCAGGCTGCTTATGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTTCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATCCCGATAAAGCCGAGGTACGTTGACATATACCGCCTACCCAGGTCCCGTCGTCCAGTCTTAGAGAACCCCGCcgcgcggggaaca > 4:496211/1‑266 (MQ=255) tGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGt < 5:395181/96‑1 (MQ=255) tGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGt > 6:395181/1‑96 (MQ=255) tGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTAt < 6:211963/149‑1 (MQ=255) tGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTAt > 8:401029/1‑149 (MQ=255) tGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTAt > 5:265124/1‑149 (MQ=255) gagaTTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCtt < 2:266912/107‑1 (MQ=255) aTTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCAtt > 4:527438/1‑133 (MQ=255) ttATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGAt > 7:370851/1‑149 (MQ=255) tGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCg < 2:527443/133‑1 (MQ=255) ggAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCtt > 5:254100/1‑149 (MQ=255) aaaCAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCgg > 7:97534/1‑149 (MQ=255) aaCAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCgg > 4:147013/1‑128 (MQ=255) aaCAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGc > 6:200975/1‑149 (MQ=255) aaggggaaGGGGATTGGGCTGTGAACTGACTATCTCCAGTCCACATAAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCA‑TCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCTTTTTTAccc < 2:496216/269‑1 (MQ=255) aGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGaa < 6:426041/149‑1 (MQ=255) ggTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCg < 2:147014/128‑1 (MQ=255) gTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACaaa > 8:262511/1‑149 (MQ=255) aTTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTc > 8:359177/1‑149 (MQ=255) agaTGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCg > 5:42008/1‑130 (MQ=255) agaTGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCg < 6:42008/130‑1 (MQ=255) aTGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCg < 8:119028/149‑1 (MQ=255) gtgGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGt > 7:103390/1‑149 (MQ=255) gtgGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGt < 7:268538/149‑1 (MQ=255) ggACTGAATATCTACAGTCCAAATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTaa > 6:125137/1‑149 (MQ=255) gACTGTAGATATTCAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAAt > 5:199546/1‑149 (MQ=255) cTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGa < 4:544255/103‑1 (MQ=255) tatatCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGCAGACAAATTTCACATCGGTAAGGACGa > 8:307866/2‑149 (MQ=255) aaTATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTc < 7:427783/133‑1 (MQ=255) aaTATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTc > 8:427783/1‑133 (MQ=255) aaTATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATTCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCAA‑TCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCtttttt > 1:71000/1‑243 (MQ=255) atatCTACAGTCCACATCAACACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCAATGGCTGCTTTTGCGTCATACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGCACCGTATGCGACCCCTTCGGCGAAGCCATCTTTCACATCGGTTATGCCGAt < 8:359234/149‑1 (MQ=255) atCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGCATTACCGAtgt < 6:186064/149‑3 (MQ=255) tCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACGGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATaaa > 8:389524/1‑149 (MQ=255) | CCGGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCA‑TCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCTTTTTTACCCGTTACCAGACCTTCCGGACCGTTCT > NC_000913/1481956‑1482493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |