| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,603,735 | 0 | G | T | 5.3% | 273.4 / 5.1 | 80 | G239G (GGG→GGT) | lsrC | autoinducer 2 import system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/39); new base T (2/3); total (38/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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gTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAg < 3:22443/121‑1 (MQ=255) tACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTCGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCACCTCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCACTCCGGCATGGTGGAATGATTGTATAGCTGGTCTGTTTCTGCTTGCGGTTCTGGTGTTCGATGGATCCTGGCTTTGTGATCGGGAACGTTGTCT‑CTGCGGGAAAAACAATGCCCCCTTACTGAcacttctcgtc > 4:62073/1‑264 (MQ=255) gggCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGAAAAAA‑TATGcc < 2:62074/249‑1 (MQ=255) ggCTGGAGATGAAAGAAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGTCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGGGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAA‑TATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCATCCGtt < 1:4358/275‑1 (MQ=255) | CGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAA‑TATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCATCCGTT > NC_000913/1603474‑1604008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |