| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 1,620,227 | 0 | C | G | 5.6% | 372.2 / 10.6 | 107 | intergenic (+20/+11) | marB/eamA | periplasmic mar operon regulator/cysteine and O‑acetyl‑L‑serine efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/50); new base G (4/2); total (55/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.45e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACATCAGAGACAAG > NC_000913/1619973‑1620496 | aggcACTTAGGCAATCATGAAACCACTTTCACCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCGTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCATCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGTGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTccc < 1:83915/272‑1 (MQ=255) 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tGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAAcc > 3:17271/1‑200 (MQ=255) gTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACtt > 2:191086/1‑157 (MQ=255) ttCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACAt < 1:143963/275‑1 (MQ=255) tCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGtt < 2:540364/125‑1 (MQ=255) tCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAAAAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACTATAACGGTGCAAACCGCCAGGTTTCCTAGCGTCCCAGTACCGTCCCCCAGATCCCATAACCAACACTTATCGCCCCAAACGcccagtacacc > 2:329059/1‑266 (MQ=255) ataagCCCCGAGATGTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGAccc > 7:72179/5‑122 (MQ=255) ataagCCCCGAGATGTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGAccc < 8:72179/118‑1 (MQ=255) cTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGcc < 1:17271/200‑1 (MQ=255) tGGCTCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCCAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGCTCAACCAACAATAGTCCCGCAc > 4:296578/1‑151 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(MQ=255) cccGAAATCTCGGTGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACATCAGAGAc < 2:326861/275‑1 (MQ=255) cGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTc < 2:92157/81‑1 (MQ=255) cGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGc > 7:82641/1‑149 (MQ=255) gACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCTGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATTCCCTAACCAACAATTTTCGCCACAAACGCCAGATACATCCGAGAAAAg > 2:342994/1‑275 (MQ=255) 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CGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACATCAGAGACAAG > NC_000913/1619973‑1620496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |