| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,754,924 | 0 | G | T | 7.1% | 440.5 / 17.8 | 126 | intergenic (‑496/+49) | yiaW/aldB | DUF3302 family inner membrane protein/aldehyde dehydrogenase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/69); new base T (4/5); total (52/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
AAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATAC > NC_000913/3754778‑3755070 | aaaCGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGt < 3:108773/148‑1 (MQ=255) cGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAg < 3:111829/148‑1 (MQ=255) cGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGc < 2:375268/149‑1 (MQ=255) tACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCg > 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gTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCatcatc > 1:296914/1‑149 (MQ=255) gTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCatcatc > 1:242082/1‑149 (MQ=255) cGTATGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATc < 4:351394/70‑1 (MQ=255) cGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTtgtg > 2:135829/1‑149 (MQ=255) gTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTgg < 1:133819/149‑1 (MQ=255) tAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGt < 1:145357/85‑1 (MQ=255) tAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTgg > 4:71020/1‑148 (MQ=255) cATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGttt < 3:77836/148‑1 (MQ=255) tGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTcgc < 1:32920/149‑1 (MQ=255) tGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTcg > 3:54561/1‑148 (MQ=255) gATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTcgcg > 1:317533/1‑149 (MQ=255) tgcgACGCTTACGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGcatcat > 4:247589/4‑132 (MQ=255) tgcgACGCTTACGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGcatcat < 3:247589/129‑1 (MQ=255) tAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGa > 4:190285/1‑148 (MQ=255) cgcgTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGAt > 3:340008/1‑148 (MQ=255) cgcgTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATa < 2:352630/149‑1 (MQ=255) | AAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTGGTTTGCTGGTAATGCTCCAGCATCATCTTGTGGGTTTCGCGACCGATAC > NC_000913/3754778‑3755070 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |