| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 617338 | 63 (0.640) | 3 (0.030) | 3/506 | 10.3 | 5.2% | coding (3182/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 618019 | 47 (0.490) | coding (3863/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCACCAACTGGTAAAGTGAGCGCCGTGGAGATTTCCCCCTATTGGACTCATTTTCAGGTTATACCCCATGTCATCACTGAATATTAAACAGGGAAGTGACGCT > NC_000913/617746‑618289 | tCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCCGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTcgcg < 2:123176/276‑1 (MQ=255) ccTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCGACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTcgcg < 1:403194/275‑1 (MQ=255) agcacagcaGGGAAGTACGTCACCGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATGGCGTAACGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACg < 1:278500/274‑1 (MQ=255) acggcagGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTa < 1:411926/271‑1 (MQ=255) agGGAAGTACTTCAACGGATTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAgg < 1:258975/275‑1 (MQ=255) agGGAAGTAATTCAACGGAGTTGTTTACCAACATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAgg < 1:116064/275‑1 (MQ=255) gAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATAttattta > 2:533525/1‑275 (MQ=255) 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tATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTaaa < 1:394628/230‑1 (MQ=255) tATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTTAATGTTGCATTAAGTGGAAGGAATTTAAAAAATTCAgtt > 4:425810/1‑274 (MQ=255) tATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAAt > 2:234644/1‑240 (MQ=255) tATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGc > 1:52652/1‑275 (MQ=255) tATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGCTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTaaa > 3:394628/1‑230 (MQ=255) aTGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCt < 1:325781/275‑1 (MQ=255) gAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGTTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGTCAGGCATTTACAAACTTCAGCTTAGGATAAtt > 2:460939/1‑276 (MQ=255) cgcCTGGGGTCCGTTGATAGCGGGGCTGGATATTTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGTTATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCa < 3:207571/275‑1 (MQ=255) gtGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCACCaa < 4:143454/275‑1 (MQ=255) 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ttGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCACCAACTGGTAAAGTGAGCGCCGTGGAGATTTCCCCCTATTGGACTCATTTTCAGGTTATACACCATGTCATCACTGAATATTAAACa < 1:313111/273‑1 (MQ=255) attCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCACCAACTGGTAAAGTGAGCGCCGTGGAGATTTCCCCCTATTGGACTCATTTTCAGGTTATACCCCATGTCATCACTGAATATTAAACAGGGAAGTGACGCt < 3:52652/275‑1 (MQ=255) | TCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCACCAACTGGTAAAGTGAGCGCCGTGGAGATTTCCCCCTATTGGACTCATTTTCAGGTTATACCCCATGTCATCACTGAATATTAAACAGGGAAGTGACGCT > NC_000913/617746‑618289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |