| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4612024 | 195 (0.940) | 13 (0.070) | 11/308 | NT | 6.4% | intergenic (+23/‑104) | osmY/ytjA | salt‑inducible putative ABC transporter periplasmic binding protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 4612030 | 194 (0.990) | intergenic (+29/‑98) | osmY/ytjA | salt‑inducible putative ABC transporter periplasmic binding protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGCCACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGATGTGCACCACACTAAAAATATCGCATTGAGTGATTTTCACGCTCATATCAAGCGGTGACATTAACTATGGTAAAGGAGACGCTTATGTTTCGTTGGGGCATCATATTTCTGGTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCA > NC_000913/4611751‑4612295 | cTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGCCACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGgcg < 4:237401/275‑1 (MQ=255) aagggCTGGGGGAAGGGCTAAGCGGGTGACACCGCCACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCTTTACCGTCATGTGAACGTTGAAACCACCGACGGCGTGGGTCAGCTCTCCGGTACAGTCGATTCTCAGGCACAAAGGGACCGGGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGAt < 4:53915/271‑1 (MQ=255) cacGGTGAAAGGCTACGCGGTGGACACCGCCACCACCAGTGAAATAAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGATGTGca < 4:92315/272‑1 (MQ=255) cTCGGTGAATGGCTACGCGGGTGACACCGCCACAACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGATGTGca < 2:230387/274‑1 (MQ=255) gAAGGGCTACGCGGGTGACACCGCAACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGATGTGCACCACACt < 2:628989/275‑1 (MQ=255) aGGGCTACGCGGGTGACACCGCCACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCCATTCCCAGGNACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGAGGGCGTGAAAAGCCGTAAAAATGATCGGAAAAATCAGTAAANAGACGTAAGTCGTCCTCCCGAACCANTTCGGGGGGCGAGAAGTGCACCACACTaaa > 3:123699/1‑276 (MQ=255) cgcgGGTGACACCGCCTCCACCCGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGCCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGCTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAACAGCGTTAAAAATGATCTGACAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCGTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGAGCTGTGGACCACACTAAAAAGATCGCAt > 1:242527/1‑279 (MQ=255) cgcgGGTGACACCGCCACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGATGTGCACCACACTAAAAATATCGCAt > 1:156460/1‑279 (MQ=255) cgcgGGTGACACCGCCACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTAGTCGTAATGCGTCTTCCCGAACTTTGtcgggaggatgaattacgacgaattccttagtttt < 4:202313‑M2/275‑36 (MQ=255) ggtgcaacCGCCACACCCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGATGTGCACCACACTAAAAATATCGCa < 2:653197/268‑1 (MQ=255) 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TGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGCCACCACCAGTGAAATCAAAGCCAAACTGCTGGCGGACGATATCGTCCCTTCCCGTCATGTGAAAGTTGAAACCACCGACGGCGTGGTTCAGCTCTCCGGTACCGTCGATTCTCAGGCACAAAGTGACCGTGCTGAAAGTATCGCCAAAGCGGTAGATGGTGTGAAAAGCGTTAAAAATGATCTGAAAACTAAGTAATTCGTCGTAATTCGTCCTCCCGAACTTTGTCGGGAGGCGCGATGTGCACCACACTAAAAATATCGCATTGAGTGATTTTCACGCTCATATCAAGCGGTGACATTAACTATGGTAAAGGAGACGCTTATGTTTCGTTGGGGCATCATATTTCTGGTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCA > NC_000913/4611751‑4612295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |