Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 475,971 | 0 | C | G | 6.9% | 687.7 / 34.6 | 202 | intergenic (+20/+11) | ybaY/ybaZ | outer membrane lipoprotein/excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (94/94); new base G (9/5); total (103/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.16e-02 |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
CGGCAGATGTTCAGCCGAACGCGCGTATTCTGTTGAGTGCGGCGATTACCGTGAATGACAAACTGGTATTTATCACCGATACCGTTCAGCCGGTGATCAACCAGGGCGGAACTAAAGCCGACCTGACATTGGTGCCGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGACATAGCCTTCGGGAATAG > NC_000913/475698‑476244 | gCAGATGTTCAGCCGAACGCGCGTATTCTGTTGAGTGCGGCGATTACCGTGAATGACAAACTGGTATTTATCACCGATACCGTTCAGCCGGTGATCAACCAGGGCGGAACTAAAGCCGACCTGACATTGGTGCCGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTCCCGTGCCTTCGACTTAACCAACTCCGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCCCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAGCCATCTCCGCCCGgaga > 1:18708/1‑279 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |