| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,333,058 | A→G | 5.3% | L21P (CTG→CCG) | rpmA ← | 50S ribosomal subunit protein L27 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,333,058 | 0 | A | G | 5.3% | 727.2 / 19.6 | 223 | L21P (CTG→CCG) | rpmA | 50S ribosomal subunit protein L27 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (101/108); new base G (5/7); total (107/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.93e-03 | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TGCGCATTTTTACCGGTTATCGAATGTAAAAAGCCCCGCAACGTGTTGCGGGGCTTTCATCCGTTACCGGGACGCGAAAAACTTATTCAGCTTCGATGCTGATAAATTTACGGTTTTTCGGGCCTTTAACTTCGAATTTCACTTTACCGTCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGACCGCAACCTACGTTAGCGCCAGCGTGGAATTTGGTACCACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACAACTTCAGCTTTGATTACGCCGCCATCAACGAAAGGAACGCCGATTTTGACTTCTTCACCGTTTGCGATC > NC_000913/3332780‑3333332 | gTTATCGAATGTAAAAAGCCCCGCAACGTGTTGCGGGGCTTTCATCCGTTACCGGTACGCGAAAAACTTATTCAGCTTCGATGCTGATAAATTTACGGTTTTTCGGGCCTTTAACTTCGAATTTCACTTTACCGTCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGACCGCAACCTACGTTAGCGCCAGCGTGGAATTTGGTACCACGTTGACGAACTATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGCAACGCTTAACGCCCATGCGTTTAGCtta > 1:15207/1‑276 (MQ=255) aaTGTAAAAAGCCCCGCAACGTGTTGCGGGGCTTTCATCCGTTACCGGGACGCGAAAAACTTATTCAGCTTCGATGCTGATAAATTTACGGTTTTTCGGGCCTTTAACTTCGAATTTCACTTTACCGTCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGACCGCAACCTACGTTAGCGCCAGCGTGGAATTTGGTACCACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAAt < 2:243719/275‑1 (MQ=255) tGTAAAAAGCCCCGCAACGTGTTGCGGGGCTTTCATCCGTTACCGGGACGCGAAAAACTTATTCAGCTTCGATGCTGATAAAGTTACGGTTTTTCGGGCCTTTAACTTCGAATTTCACTTTACCGTCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGACCGCAACCTACGTTAGCGCCAGCGTGGAATTTGGTACCACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATcg < 2:84802/275‑1 (MQ=255) gaaaaaGCCCCGGAACTGGTTGCGGGGCTTTCATCCGTTACCGGGACGCGAAAAACTTATTCAGCTTCGATGCTGATAAATTTACGGTTTTTCGGGCCTTTAACTTCGAATTTCACTTTACCGTCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGACCGCAACCTACGTTAGCGCCAGCGTGGAATTTGGTACCACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATcgcg < 4:366333/274‑1 (MQ=255) 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tACCACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTAt > 6:745110/1‑120 (MQ=255) aCCACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTa < 5:430288/149‑1 (MQ=255) cccGTTGCCGAACGATGATCTTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACAACtt < 4:180822/270‑1 (MQ=255) cACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAAtct > 3:37695/1‑133 (MQ=255) cGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCCTTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCt > 1:33323/1‑151 (MQ=255) 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(MQ=255) gatgatGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGaaa > 2:302309/1‑215 (MQ=255) tgCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGcc > 8:944465/1‑141 (MQ=255) tACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTca > 5:789964/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCa < 8:367420/118‑1 (MQ=255) aCCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTcac > 6:857649/1‑149 (MQ=255) cccGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTcaca > 5:1065935/1‑149 (MQ=255) cccGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACCACTTCAGCTTTGATTACGCACCCATCCACg > 4:129178/1‑275 (MQ=255) cGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGACGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTANTTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTCCTTACGATAGTGTTTACGACGACTAAACTTAACGATTTTATCTNCTTCCCCACCACCGTCATCAACAATNCCATCTTTTCTTAAACCCCCACCCACGaaaaaa > 3:132876/1‑276 (MQ=255) cAGAACGGATCCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGCCCGTGAGCAACAACTTCAGCTTTTATTACGCCGCCCTCAACGAAAg > 4:221379/1‑274 (MQ=255) aGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTg > 6:461699/1‑149 (MQ=255) gATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCAc > 5:310202/1‑149 (MQ=255) cGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGAc < 6:989426/149‑1 (MQ=255) gCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCATTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACg > 6:641225/1‑149 (MQ=255) gCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACg > 5:188076/1‑149 (MQ=255) gCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACAACTTCAGCTTTGATTACGCCGCCATCAACGAAAGGAACGCCGAtttt < 2:683585/275‑1 (MQ=255) ccACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACg > 8:424468/1‑148 (MQ=255) ccACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGc > 2:258058/1‑153 (MQ=255) aCCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGAt > 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aagCTAAACGCCTGGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGaa > 7:1008806/3‑80 (MQ=255) ccctccaCGCCCGGGCTTTTCGCTTCTTAANCNTNACCGTTCCTGGGTGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCTATTTTAAANCTCTCCTCAGGTCTTGGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTNCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACAACTTCAGCTTTGATTACGCCGCCATCAACGAAAGGAACGCCGATTTTGACTTCTTCACCGt < 3:77983/273‑1 (MQ=255) cTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTGACGTGTGGAGCCGCCAACCTTTGTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTGACATCAGTGAACCACTGACGATCGCCctgct > 7:655089/1‑148 (MQ=255) aaCGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTgctgct < 8:1004035/148‑1 (MQ=255) cGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACAACTTCAGCTTTGATTACGCCGCCATCAACGAAAGGAACGCCGATTTTGACTTCTTCACCGTTTg < 2:235573/275‑1 (MQ=255) cccAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGaaa > 7:881162/1‑71 (MQ=255) cccAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGAACGTTAAGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACAACTTCAGCTTTGATTACGCCGCCATCAACGAAAGGAACGCCGATTTTGACTTCTTCACCGTTTGCg < 4:510751/275‑1 (MQ=255) ccAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAgg < 6:232256/82‑1 (MQ=255) cAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATa < 5:596701/149‑1 (MQ=255) | TGCGCATTTTTACCGGTTATCGAATGTAAAAAGCCCCGCAACGTGTTGCGGGGCTTTCATCCGTTACCGGGACGCGAAAAACTTATTCAGCTTCGATGCTGATAAATTTACGGTTTTTCGGGCCTTTAACTTCGAATTTCACTTTACCGTCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGACCGCAACCTACGTTAGCGCCAGCGTGGAATTTGGTACCACGTTGACGAACGATGATGCTACCCGCCAGAACGGATTCGCCACCGAAACGCTTAACGCCCAGGCGTTTAGCTTCTGAATCGCGACCGTTACGTGTGGAGCCGCCAGCCTTTTTATGTGCCATTTGAAATCTCTCCTCAGGTCTTAGGCGCTGATGCCAGTAATTTTCACATCAGTGAACCACTGACGATGGCCCTGCTGCTTACGATAGTGTTTACGACGACGAAACTTAACGATTTTAACTTTCTCGCCACGACCGTGAGCAACAACTTCAGCTTTGATTACGCCGCCATCAACGAAAGGAACGCCGATTTTGACTTCTTCACCGTTTGCGATC > NC_000913/3332780‑3333332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |