| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 481,225 | 0 | T | G | 8.9% | 441.4 / 30.9 | 134 | intergenic (‑517/+29) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/51); new base G (6/6); total (77/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCATCCCGCCCATTACACCGGTACCTACTGCGTTCTGCGCGCCGGAACCAGCACCAGTACTGATAACCAGCGGCATAACGCCGAGGATAAACGCCAGCGAGGTCATCAGGATCGGACGT > NC_000913/480955‑481488 | gCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAcg < 4:651154/275‑1 (MQ=255) 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aaGNCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATg > 7:931038/1‑58 (MQ=255) aaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATg < 8:931038/58‑1 (MQ=38) ccGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAGAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTc > 8:864229/1‑148 (MQ=255) gCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACgaa > 5:211315/1‑121 (MQ=255) gCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCAc > 8:45983/1‑148 (MQ=255) gCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCAc > 7:624857/1‑148 (MQ=255) ttACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCAt > 5:214723/1‑149 (MQ=255) | GCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCATCCCGCCCATTACACCGGTACCTACTGCGTTCTGCGCGCCGGAACCAGCACCAGTACTGATAACCAGCGGCATAACGCCGAGGATAAACGCCAGCGAGGTCATCAGGATCGGACGT > NC_000913/480955‑481488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |