Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,657,603 | 0 | T | A | 7.4% | 555.4 / 24.5 | 163 | intergenic (+36/+383) | hdeD/arrS | acid‑resistance membrane protein/antisense sRNA ArrS, function unknown |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/84); new base A (9/3); total (76/87) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.84e-01 |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
CGGTTTGTTCTGTGTTGCAGGGGTTATTCGCCTGATGAGTTGGTATCGTCAGCGTTCAATGAAAGGCAGCTGGCTACAGCTCGTTATTGGTGTGCTGGATATCGTCATTGCCTGGATATTCCTTGGTGCAACGCCGATGGTGTCTGTAACGCTGGTTTCCACACTGGTGGGAATTGAACTGATATTTAGCGCCGCCAGCCTGTTCAGCTTCGCCAGTTTGTTCGTTAAGCAGCAATAATTACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTAT‑CATTGAAATAATTACCTGC‑TAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCAAATTAGCCATTTCAAACATTATCATGGCTGATATTTTCCGTAGTCAGGTTTAATGTTTTAAAAGTGCTGTGGGAAAGTGAACAAAGAGTTCCGTAAGCGTTGATGCTATGGGCGGTTAAATAAGTAATCCGGGTTCAT > NC_000913/3657330‑3657875 | cGGTTTGTTCTGTGTTGCAGGGGTTATTCGCCTGATGAGTTGGTATCGTCAGCGTTCAATGAAAGGCAGCTGGCTACAGCTCGTTATTGGTGTGCTGGATATCGTCATTGCCTGGATATTCCTTGGTGCAACGCCGATGGTGTCTGTAACGCTGGTTTCCACACTGGTGGGAATTGAACTGATATTTAGCGCCGCCAGCCTGTTCAGCTTCGCCAGTTTGTTCGTTAAGCAGCAATAATTACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGAtg < 2:125032/275‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |