| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 709178 | 87 (0.790) | coding (845/1407 nt) | chiP | chitoporin, uptake of chitosugars | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
AAATAACTTCGTACTGGAAGCGGCATTTGGTCAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCAACGTATGAC > NC_000913/709026‑709319 | aaaTAACTTCGTACTGGAAGCGGCATTTGGTCAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGAt > 3:17638/1‑148 (MQ=255)aaaTAACTTCGTACTGGAAGCGGCATTTGGTCAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATc < 2:834793/149‑1 (MQ=255)aaaTAACTTCGTACTGGAAGCGGCATTTGGTCAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATc < 2:953314/149‑1 (MQ=255) ttCGTACTGGAAGCGGCATTTGGTCAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGcgt < 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tttGGTCAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAg > 3:697290/1‑128 (MQ=255) cAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGATGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCg < 3:113248/148‑1 (MQ=255) cAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGctgcgatcgtcaa < 3:606642‑M1/128‑14 (MQ=255) ggCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGcc > 4:387744/1‑148 (MQ=255) ggAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGc < 1:286169/149‑1 (MQ=255) gAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCt < 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atatTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTg < 1:640727/149‑1 (MQ=255) atatTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTg > 2:135075/1‑149 (MQ=255) ttttGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGtt > 2:445963/1‑149 (MQ=255) ttGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTAc < 1:366483/149‑1 (MQ=255) cAAAGCCAACTATAAAGTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCggg > 2:475561/1‑149 (MQ=255) aaaGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCg < 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gagaTAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTc > 1:902522/1‑149 (MQ=255) aTAAAGTTGACGATCGCAGcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtggttaacgggctaccggcgatatcaaatttgtagctggctttggcaaaatattgatcgatatacccttccgcctgaccaaatgccgcttc < 2:13380‑M2/149‑131 (MQ=255) aaaGTTGACGATCGCAGcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtg < 3:898356‑M2/58‑42 (MQ=255) aaaGTTGACGATCGCAGcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtg > 4:898356‑M2/1‑17 (MQ=255) aaGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCaa < 1:498955/149‑1 (MQ=255) aGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCAAc < 2:822992/149‑1 (MQ=255) gTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCAACg > 2:316999/1‑149 (MQ=255) ttGACGATCGCAGcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtggttaacgggctaccggcgatatcaaatttgtagctggctttggcaaaatattgatcgatatacccttccgcctg > 4:606642‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGACGATCGCAGcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtggttaacgggctaccggcgatatcaaatttgtagctggctttggcaaaatattgatcgatatacccttccgcctg < 3:606642‑M2/128‑116 (MQ=255) ttGACGATCGCAGcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtg < 2:464006‑M2/54‑42 (MQ=255) ttGACGATCGCAGcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtg > 1:464006‑M2/1‑13 (MQ=255) gACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCAACGTAt < 2:104637/149‑1 (MQ=255) aCGctgcgatcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtggttaacgggctaccggcgatatcaaatttgtagctggctttggcaaaatattgatcgatatacccttccgcctgaccaaatgccgcttccagtacgaa < 1:92389‑M1/149‑147 (MQ=255) aCGctgcgatcgtcaactttatctcgggtaccgtagaactggtagctggtggttaacgggctaccggcgatatcaaatttgtagctggctttggcaaaatattgatcgatatacccttccgcctgaccaaatgccgcttccagtacga < 3:365316‑M1/148‑146 (MQ=255) cGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCAACGTATg < 4:786981/148‑1 (MQ=255) gATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCAACGTATGAc > 1:1010672/1‑149 (MQ=255) | AAATAACTTCGTACTGGAAGCGGCATTTGGTCAGGCGGAAGGGTATATCGATCAATATTTTGCCAAAGCCAGCTACAAATTTGATATCGCCGGTAGCCCGTTAACCACCAGCTACCAGTTCTACGGTACCCGAGATAAAGTTGACGATCGCAGCGTCAACGACCTTTATGACGGCACCGCCTGGCTGCAAGCGTTGACCTTTGGTTACCGGGCGGCTGACGTAGTGGATTTGCGCCTCGAAGGCACCTGGGTTAAGGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCAACGTATGAC > NC_000913/709026‑709319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |