| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,136,027 | T→A | 5.2% | V155E (GTA→GAA) ‡ | flgH → | flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,136,027 | 0 | T | A | 5.2% | 318.3 / 4.9 | 91 | V155E (GTA→GAA) ‡ | flgH | flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/44); new base A (3/2); total (45/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTTGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > NC_000913/1135879‑1136174 | tttGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGt > 2:578687/1‑149 (MQ=255) ttGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTa < 2:318144/149‑1 (MQ=255) tACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTgg > 2:1012230/1‑149 (MQ=255) gtgCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGTAC‑CTGGTCaa < 1:188204/149‑1 (MQ=255) gtgCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGTAC‑CTGGTCaa < 2:48538/149‑1 (MQ=255) tttGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTg < 3:162462/148‑1 (MQ=255) tGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCAt < 2:22762/149‑1 (MQ=255) tGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTAGTAACACGTTCATCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCa > 4:777735/1‑148 (MQ=255) aGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCAtgtg > 2:254730/1‑149 (MQ=255) ggggCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATgtgg > 2:398299/1‑149 (MQ=255) gCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGtggtgg < 1:815826/149‑1 (MQ=255) cTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGtggtgg < 4:259112/148‑1 (MQ=255) gTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaaca < 2:855893/149‑3 (MQ=255) gTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaaa < 3:82346/148‑1 (MQ=255) gTAACGCTCGTGCCGAAGGCAAAGCCACCGGTGGGAACACGTTCAACGTAAAGGGCGGGGCCAATGTGAGCAATACCTATAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAAACTGCATGTGGTGGGTGaaaaa < 2:32740/149‑1 (MQ=255) tAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaaaa < 3:735532/148‑1 (MQ=255) aaCGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACa > 1:287394/1‑149 (MQ=255) aCGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaaaa < 1:740239/146‑1 (MQ=255) aCGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaaaa > 2:740239/1‑146 (MQ=255) cGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAg > 3:58109/1‑148 (MQ=255) cGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGa < 2:543735/149‑1 (MQ=255) gCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGAt < 1:613885/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGAtt > 2:830163/1‑149 (MQ=255) cGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTa > 2:1065871/1‑149 (MQ=255) aTGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAAt < 1:1014277/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACC‑TTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAg < 3:88765/148‑1 (MQ=255) cGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAgg < 2:670473/149‑1 (MQ=255) cGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAg < 3:1052404/148‑1 (MQ=255) cGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGACAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAgg < 1:499568/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAggg < 2:275109/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCGTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAgg < 4:347516/148‑1 (MQ=255) aaGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGt > 1:41997/1‑149 (MQ=255) tCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGa > 1:470568/1‑149 (MQ=255) tggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCa > 3:792690/1‑135 (MQ=255) tggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCa < 4:792690/135‑1 (MQ=255) ggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAt > 1:834582/1‑149 (MQ=255) gtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAtt < 1:254730/149‑1 (MQ=255) tAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTc < 2:959081/149‑1 (MQ=255) acacGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGc > 2:976321/1‑149 (MQ=255) gTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGcc > 1:338211/1‑118 (MQ=255) gTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGcc < 2:338211/118‑1 (MQ=255) ttCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTtct < 4:728414/148‑1 (MQ=255) tCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTctct < 1:830163/149‑1 (MQ=255) aaCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGAt < 2:496255/110‑1 (MQ=255) aaCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGAt > 1:496255/1‑110 (MQ=255) aCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTgg < 3:919161/148‑1 (MQ=255) aCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGc < 1:820629/149‑1 (MQ=255) gAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCg > 3:635362/1‑136 (MQ=255) gAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCg < 4:635362/136‑1 (MQ=255) gAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGt > 3:144919/1‑148 (MQ=255) gAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTg < 1:398299/149‑1 (MQ=255) aaaGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTgg < 2:990474/149‑1 (MQ=255) aaGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑t < 2:470568/149‑1 (MQ=255) ggCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTaa < 2:640889/149‑1 (MQ=255) ggCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTaa < 1:1065871/149‑1 (MQ=255) gCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAAt < 1:1012230/149‑1 (MQ=255) cGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATc < 1:473631/149‑1 (MQ=255) ggggCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATcc > 2:606923/1‑149 (MQ=255) ggggCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATcc > 2:35483/1‑149 (MQ=255) ggCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCATGG‑TTAATCCAc < 1:527133/149‑1 (MQ=255) ccAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTATCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACg > 4:717820/1‑148 (MQ=255) ccAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTAt > 4:311149/1‑148 (MQ=255) cAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGATTAA‑CCACGccagagaa < 2:541862/149‑8 (MQ=255) cAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCa > 1:862927/1‑149 (MQ=255) gCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAGCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAg > 3:91456/1‑148 (MQ=255) gCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAg < 4:144919/148‑1 (MQ=255) aaTACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCgg > 1:822283/1‑149 (MQ=255) aCCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTtct > 3:194644/1‑115 (MQ=255) aCCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTtct < 4:194644/115‑1 (MQ=255) aCCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGgca > 3:92029/1‑148 (MQ=255) tttAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCaa > 1:303569/1‑149 (MQ=255) 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gtgacggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCa > 2:819292/1‑149 (MQ=255) acggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAgg > 3:153658/1‑148 (MQ=255) gtTGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg > 4:207153/1‑148 (MQ=255) gtTGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg > 3:309932/1‑148 (MQ=255) gtTGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg > 4:391294/1‑148 (MQ=255) gtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg < 3:7737/148‑1 (MQ=255) gtTGACCA‑GTACCTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg > 4:297961/1‑148 (MQ=255) ccAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAt > 3:329568/1‑148 (MQ=255) cAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgc > 1:124380/1‑149 (MQ=255) cAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATg > 4:157285/1‑148 (MQ=255) aGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcg > 2:113178/1‑149 (MQ=255) aGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgc > 4:601622/1‑148 (MQ=255) aGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgc > 4:249490/1‑148 (MQ=255) ggTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcg > 3:636400/1‑148 (MQ=255) gTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTCCTCAGGTGGCGGATgcgcg > 1:166592/1‑149 (MQ=255) tA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgcg < 4:404559/148‑1 (MQ=255) | TTTGATACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG‑TTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > NC_000913/1135879‑1136174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |