Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,149,988 | G→C | 5.3% | M87I (ATG→ATC) | fabD → | malonyl‑CoA‑[acyl‑carrier‑protein] transacylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,149,988 | 0 | G | C | 5.3% | 402.1 / 10.4 | 113 | M87I (ATG→ATC) | fabD | malonyl‑CoA‑[acyl‑carrier‑protein] transacylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/51); new base C (2/4); total (58/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CGCTGGGCTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCAATCATC > NC_000913/1149843‑1150135 | cgcTGGGCTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAatgatg < 1:895415/149‑1 (MQ=255) cgcTGGGCTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAatgatg < 2:907873/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGc < 2:124130/149‑1 (MQ=255) gCTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCCATCATTGCCgg < 3:595362/148‑1 (MQ=255) cTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCCATCATTGCCGGt < 3:410956/148‑1 (MQ=255) cTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTc > 2:901969/1‑149 (MQ=255) tACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCCATCATTGCCGGtg < 3:99545/148‑2 (MQ=255) aCGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTca > 3:855716/1‑148 (MQ=255) cGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTcac > 4:878034/1‑148 (MQ=255) cTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCt > 1:751228/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCt > 2:825284/1‑149 (MQ=255) gtgGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTg < 3:618340/148‑1 (MQ=255) gggCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTgggg < 2:1072409/149‑1 (MQ=255) gcTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAAt < 2:824250/149‑1 (MQ=255) gcTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAAt < 1:301248/149‑1 (MQ=255) cTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAAt > 4:292125/1‑148 (MQ=255) cTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAAt < 4:236416/148‑1 (MQ=255) ccAGCAGGGACCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCcg > 1:380026/1‑149 (MQ=255) cagcagGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCCGGGCGGTCAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCcg > 3:725859/1‑148 (MQ=255) cagcagGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCcg > 4:450142/1‑148 (MQ=255) gcagGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCcgcg < 3:1056729/148‑1 (MQ=255) ggggCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTgg > 3:963603/1‑131 (MQ=255) ggggCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTgg < 4:963603/131‑1 (MQ=255) ccAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGttt > 4:702089/1‑148 (MQ=255) cTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGCCTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTgcgc > 3:604987/1‑148 (MQ=255) aagaaCTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGgt < 1:799898/149‑1 (MQ=255) gaaCTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGgtgt < 1:134217/149‑1 (MQ=255) aaCTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGgtgt < 4:604987/148‑1 (MQ=255) aCTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtga < 1:407883/149‑1 (MQ=255) cTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtgat > 2:1061707/1‑149 (MQ=255) cTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtgat > 1:804174/1‑149 (MQ=255) gattataaCCTCGCAAACTCAGCCGGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGGGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGTACACAGCATGGGGGAATACCTCGCTCTTGTTTGCGATGGTGtgatt > 4:513984/7‑148 (MQ=255) gAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGtgtg < 4:299563/145‑1 (MQ=255) gAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGtgtg > 3:299563/1‑145 (MQ=255) gAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtgatt > 3:330322/1‑148 (MQ=255) aaTAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtgattga > 1:255873/1‑149 (MQ=255) aTAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtgattgat > 1:722295/1‑149 (MQ=255) aTAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtgattga > 3:422115/1‑148 (MQ=255) tAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGtgattgat < 4:422115/148‑1 (MQ=255) aaaaCCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTgattgatt < 3:505290/148‑1 (MQ=255) aaaaCCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGAttt < 1:341171/149‑1 (MQ=255) aaaCCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGAttt > 4:925170/1‑148 (MQ=255) aaCCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTgggg < 2:407898/109‑1 (MQ=255) aaCCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTgggg > 1:407898/1‑109 (MQ=255) aCCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCg > 3:320143/1‑148 (MQ=255) ccTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGc > 4:216629/1‑148 (MQ=255) ccTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCt < 1:825284/149‑1 (MQ=255) ggCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGa > 4:967125/1‑148 (MQ=255) aaaCTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGc > 4:895815/1‑148 (MQ=255) aaaCTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGCTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCg < 1:865677/149‑1 (MQ=255) aaCTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCgg > 2:410294/1‑149 (MQ=255) aaCTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGATGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCg > 4:690606/1‑148 (MQ=255) aCTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGt > 1:1063599/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGCTGCGTTCCGTc < 2:734616/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGt < 2:804174/149‑1 (MQ=255) cgcTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGt < 3:878034/148‑1 (MQ=255) cTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTg < 4:150011/148‑1 (MQ=255) gTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTgaga < 1:794174/149‑1 (MQ=255) gTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTgaga > 1:1027057/1‑149 (MQ=255) gCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGcgcg > 3:711955/1‑148 (MQ=255) aTCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCa > 2:820248/1‑149 (MQ=255) tCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCa < 3:450142/148‑1 (MQ=255) cTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCaa > 4:707694/1‑148 (MQ=255) gTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGt < 4:479017/148‑1 (MQ=255) gcgcTGTATCGCGTATGGCAGCTGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCCGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCa < 4:871879/148‑1 (MQ=255) gcgcTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCa < 4:560014/148‑1 (MQ=255) gcTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATg > 2:381934/1‑148 (MQ=255) gTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCa > 3:343362/1‑143 (MQ=255) aTCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCaagaa < 1:451681/149‑1 (MQ=255) tCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCaagaag > 2:446118/1‑149 (MQ=255) tCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCaagaag > 2:1060043/1‑149 (MQ=255) cgcgTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCaagaag > 4:175582/1‑148 (MQ=255) gcgTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGcc > 2:967219/1‑149 (MQ=255) tATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGt > 4:811951/1‑148 (MQ=255) aTGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTa > 3:582495/1‑148 (MQ=255) aTGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTa < 3:292125/148‑1 (MQ=255) gcagcagcaGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTgag < 2:335979/115‑1 (MQ=255) gcagcagcaGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTgag > 1:335979/1‑115 (MQ=255) agcagcagGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGaa < 2:255873/149‑1 (MQ=255) agcagcagGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGa < 4:219646/148‑1 (MQ=255) gcagcagGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGaa < 3:85299/148‑1 (MQ=255) gggCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACg < 4:981118/148‑1 (MQ=255) ggCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACggg < 2:938495/149‑1 (MQ=255) gCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACggg > 3:416630/1‑148 (MQ=255) gCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACggg < 4:320143/148‑1 (MQ=255) tgtgaCCGGCCATCATTGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATg > 1:905422/5‑149 (MQ=255) aaGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATg < 1:782881/149‑1 (MQ=255) aaGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATg > 2:26058/1‑149 (MQ=255) aaGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATg < 2:722295/149‑1 (MQ=255) gtgaCCGGCCATCATTGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATg > 4:823873/4‑148 (MQ=255) aGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATg > 4:704886/1‑148 (MQ=255) aCCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATggcgg > 1:151706/1‑149 (MQ=255) aCCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATggcg < 4:330322/148‑1 (MQ=255) cGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCa > 2:455673/1‑149 (MQ=255) ggCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATAGCGGCa > 4:274892/1‑148 (MQ=255) cAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCAat > 4:567907/1‑148 (MQ=255) cAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGCGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCAat > 4:713115/1‑148 (MQ=255) atgatgGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCAatcat > 1:294939/1‑149 (MQ=255) tgatgGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCAatcatc < 1:182350/149‑1 (MQ=255) tgatgGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCAatcatc < 1:820248/149‑1 (MQ=255) | CGCTGGGCTACGACCTGTGGGCGCTGACCCAGCAGGGGCCAGCTGAAGAACTGAATAAAACCTGGCAAACTCAGCCTGCGCTGTTGACTGCATCTGTTGCGCTGTATCGCGTATGGCAGCAGCAGGGCGGTAAAGCACCGGCAATGATGGCCGGTCACAGCCTGGGGGAATACTCCGCGCTGGTTTGCGCTGGTGTGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCGTACCGGAAGGCACGGGCGCTATGGCGGCAATCATC > NC_000913/1149843‑1150135 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |