| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 87,887 | C→T | 9.7% | intergenic (+39/‑141) | ilvH → / → cra | acetolactate synthase 3, small subunit, valine‑sensitive/transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 87,887 | 0 | C | T | 9.7% | 276.4 / 14.2 | 91 | intergenic (+39/‑141) | ilvH/cra | acetolactate synthase 3, small subunit, valine‑sensitive/transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/47); new base T (6/3); total (41/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTGAAAC > NC_000913/87743‑88034 | tAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGtt < 3:101800/148‑1 (MQ=255)tAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTg < 1:262491/149‑1 (MQ=255) aaGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTg < 3:556225/148‑1 (MQ=255) aGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTggg < 1:371316/149‑1 (MQ=255) cTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACGTGACATGTTGGGCt < 2:578474/149‑1 (MQ=255) tGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCtt < 4:821190/148‑1 (MQ=255) gATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCttt < 4:606579/148‑1 (MQ=255) gATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCttt < 4:511414/148‑1 (MQ=255) aTGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCtttt > 4:38270/1‑148 (MQ=255) aTGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCtttt < 4:311574/148‑1 (MQ=255) aTTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAGATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTg < 3:861548/148‑1 (MQ=255) tttttAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCg > 1:1007175/1‑149 (MQ=255) ttttAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCg > 3:959648/1‑148 (MQ=255) gCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCa < 1:34346/149‑1 (MQ=255) cATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCa < 3:778123/148‑1 (MQ=255) aTCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTAGCGAAATCAGt < 1:561870/149‑1 (MQ=255) tCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGt > 4:501337/1‑148 (MQ=255) tCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGt > 4:458723/1‑148 (MQ=255) tCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGt < 3:976823/148‑1 (MQ=255) cGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACGTGACATGTTggg < 3:838853/128‑1 (MQ=255) cGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACGTGACATGTTggg > 4:838853/1‑128 (MQ=255) ttCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGaa < 1:594468/149‑1 (MQ=255) gcgATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCt < 2:498114/149‑1 (MQ=255) cgATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTg < 1:802048/149‑1 (MQ=255) cgATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGATGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCt < 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ggCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATaa < 1:249083/149‑1 (MQ=255) gCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTg > 1:395299/1‑134 (MQ=255) gCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTg < 2:395299/134‑1 (MQ=255) cGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCATGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATaaaa < 2:615642/149‑1 (MQ=255) cGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATaaaa < 1:633388/149‑1 (MQ=255) cGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATaaa < 3:38270/148‑1 (MQ=255) gAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAg > 2:1020233/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGt > 1:95327/1‑149 (MQ=255) ttGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGt > 4:766463/1‑148 (MQ=255) tcgctcTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAtt > 2:425708/1‑149 (MQ=255) tcgctcTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAt < 4:538863/148‑1 (MQ=255) cgctcTGGTGTGGACGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAAACTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAtt > 3:574046/1‑148 (MQ=255) ctctGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAtttt < 4:498766/148‑1 (MQ=255) tctGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCt > 1:1050083/1‑149 (MQ=255) tgGTCGGACTTTCGCGCGTCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCtt < 3:1038005/148‑1 (MQ=255) ggTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTa < 4:361769/148‑1 (MQ=255) gTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTCAGa > 1:582041/1‑149 (MQ=255) tCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGa < 3:17774/148‑1 (MQ=255) tCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGAt > 1:364533/1‑149 (MQ=255) cTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTa < 4:641100/148‑1 (MQ=255) ttCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAAt > 4:199949/1‑148 (MQ=255) 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gTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACaa < 4:13572/148‑1 (MQ=255) tGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATgg < 2:1050083/149‑1 (MQ=255) gaATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTa > 1:490820/1‑149 (MQ=255) aaTGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTa > 4:408032/1‑148 (MQ=255) aaTGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTAt < 2:368781/149‑1 (MQ=255) aaTGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTAt < 1:1016213/149‑1 (MQ=255) aaTGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTAt < 2:95200/149‑1 (MQ=255) aaTGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTAt < 1:429269/149‑1 (MQ=255) tctcAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGttt > 2:906640/1‑149 (MQ=255) tctcAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGtt > 4:42211/1‑148 (MQ=255) 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cAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTCTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTATACGCAAgg < 2:95327/149‑1 (MQ=255) aaGCCCAACGTGACATGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAg > 3:844297/2‑148 (MQ=255) cccAACGTGACATGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGc > 1:892817/1‑149 (MQ=255) ccAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGc > 4:533390/1‑148 (MQ=255) aCATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGaa < 4:73343/93‑1 (MQ=255) aCATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGaa > 3:73343/1‑93 (MQ=255) aCATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAAt > 4:484189/1‑148 (MQ=255) aCATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAAt > 4:58564/1‑148 (MQ=255) tCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATAc > 1:522400/1‑100 (MQ=255) tCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATAc < 2:522400/100‑1 (MQ=255) tCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTGaa > 1:549574/1‑149 (MQ=255) cACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTGaa > 4:122670/1‑148 (MQ=255) aCGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTGAAAc > 2:441100/1‑149 (MQ=255) cGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTGAAAc > 3:547205/1‑148 (MQ=255) | TAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTGAAAC > NC_000913/87743‑88034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |