Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 3,035,480 | T→C | 5.5% | T268A (ACC→GCC) ‡ | prfB ← | peptide chain release factor RF‑2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,035,480 | 0 | T | C | 5.5% | 410.3 / 9.3 | 127 | T268A (ACC→GCC) ‡ | prfB | peptide chain release factor RF‑2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/59); new base C (4/3); total (65/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.96e-01 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGA > NC_000913/3035335‑3035627 | tCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCgg > 2:352478/1‑149 (MQ=255) cGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCgg < 4:973560/148‑1 (MQ=255) cGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGAGCCCGGTCggg > 1:1069075/1‑149 (MQ=255) gATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGACCGGGAt < 1:790577/149‑1 (MQ=255) tttGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGAtgt < 1:1027163/149‑1 (MQ=255) tttGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGAtgt < 2:305716/149‑1 (MQ=255) tGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGAtgtg < 3:670355/148‑1 (MQ=255) tGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTgg < 1:953257/149‑1 (MQ=255) tGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTgg < 2:854414/149‑1 (MQ=255) gTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACTATCCCGGTCGGGATGTgg < 4:769197/148‑1 (MQ=255) aTCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTaa < 2:491304/149‑1 (MQ=255) aTCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTa < 4:318020/148‑1 (MQ=255) ttCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATa > 3:392033/1‑148 (MQ=255) 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ccAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGAccgcc > 4:391412/1‑148 (MQ=255) ccAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGAccgcc > 4:297053/1‑148 (MQ=255) ttCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCcgcg < 3:297053/148‑1 (MQ=255) tCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGcc < 2:745792/149‑1 (MQ=255) aTAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCgg > 1:433436/1‑149 (MQ=255) 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ttCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATatcatcat > 4:483328/1‑148 (MQ=255) tCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATatcatcatc > 3:748853/1‑148 (MQ=255) cTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa < 1:1048996/149‑1 (MQ=255) tGGCACTGGGTCAAGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTAGGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACCTCAATGCGCTGATCCGCCGGGTTGATTTCGCTATCAATATCATCATCAAc < 1:1024492/149‑1 (MQ=255) aCTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTAc < 1:1020473/54‑1 (MQ=255) gggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGa < 2:967003/149‑1 (MQ=255) 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cACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaa < 4:170786/148‑1 (MQ=255) aCGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCTTACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaa < 4:482026/148‑1 (MQ=255) aCGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaa > 4:66072/1‑148 (MQ=255) aCGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaa > 4:763100/1‑148 (MQ=255) cGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaaca > 1:845940/1‑149 (MQ=255) acaTCCCGACCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTc < 1:189303/113‑1 (MQ=255) aTCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaacaa < 3:483328/148‑1 (MQ=255) cccGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaacaaac > 3:662800/1‑148 (MQ=255) gTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCgg < 3:238549/148‑1 (MQ=255) tCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGa > 4:332919/1‑148 (MQ=255) | TCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGA > NC_000913/3035335‑3035627 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |