Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 847,214 | 0 | T | A | 8.1% | 400.3 / 19.0 | 122 | intergenic (‑95/+44) | glnP/glnH | glutamine transporter subunit/glutamine transporter subunit |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ACCTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCTCGTCGCT > NC_000913/847066‑847362 | ccTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATa < 1:439336/149‑1 (MQ=255) cTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑g > 1:656134/1‑149 (MQ=255) tCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGgaga < 2:802517/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGt > 3:33502/1‑148 (MQ=255) tAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTattatt < 4:910488/63‑1 (MQ=255) tAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTattatt > 3:910488/1‑63 (MQ=255) aaTCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCa > 4:116537/1‑148 (MQ=255) ctctCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAggg > 2:184577/1‑118 (MQ=255) tctcCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCgg > 3:92353/1‑61 (MQ=255) tctcCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCgg < 4:92353/61‑1 (MQ=255) tcCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCt < 4:680664/148‑1 (MQ=255) cccATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCtcgt > 1:33344/1‑149 (MQ=255) cccATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACAGAACCACTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCACGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCCGCtcg > 4:687304/1‑148 (MQ=255) cccATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTAGTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCtcgt > 1:615223/1‑149 (MQ=255) ccATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCtcgtc > 1:89401/1‑149 (MQ=255) ccATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCtcgtc > 2:439302/1‑149 (MQ=255) ccATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCtcgt < 4:2695/148‑1 (MQ=255) cATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCtcgtcg > 1:107061/1‑149 (MQ=255) tA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCTCGTCGCt > 1:14843/1‑149 (MQ=255) | ACCTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCTCGTCGCT > NC_000913/847066‑847362 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |