| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,413,966 | 0 | T | A | 5.8% | 586.1 / 21.2 | 171 | intergenic (‑39/+18) | ralR/recT | Rac prophage; restriction alleviation protein/Rac prophage; recombination and repair protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/87); new base A (6/4); total (80/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATAT > NC_000913/1413820‑1414113 | tCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTa < 1:599192/149‑1 (MQ=255) tCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGcc < 1:1171048/149‑1 (MQ=255) tCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATAGTTCAAGTTGGCGGTGTAATGCACCGcc < 3:820947/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |