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ccAGTCATTACTGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCaa < 2:725401/149‑1 (MQ=255) ccAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGaa < 3:1043018/90‑1 (MQ=255) ccAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGaa > 4:1043018/1‑90 (MQ=255) ccAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCaa > 3:1555760/1‑149 (MQ=255) ccAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCaa < 1:176659/149‑1 (MQ=255) ccAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCaa > 3:1426052/1‑149 (MQ=255) cagtcagtAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACAt > 3:902606/1‑127 (MQ=255) tcagtAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGCCCGGATACGCCACATCCGGGACaa < 1:1352809/133‑1 (MQ=255) tcagtAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGAAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACaa > 2:1352809/1‑133 (MQ=255) cagtAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGaaaa < 1:596405/149‑1 (MQ=255) | TGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAA > NC_000913/4049840‑4050132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |