| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2493676 = | 142 (0.750) | 7 (0.040) | 7/230 | NT | 5.6% | intergenic (‑422/+91) | frc/yfdX | formyl‑CoA transferase, NAD(P)‑binding/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 2493713 = | 110 (0.650) | intergenic (‑459/+54) | frc/yfdX | formyl‑CoA transferase, NAD(P)‑binding/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
CGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATCGACGATGATTCCATCTTCCGCACCTTTAA > NC_000913/2493528‑2493822 | aggTGATATACAAGAAAGGGTATAATTACTGTTTTGAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAACGATTTGTGATGACACGAGATTATTGTGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAATTTATAGCACCGCTAGCGTCAaataat < 4:681028/148‑1 (MQ=255) ttgataaaaagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgccaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattttt < 2:1403043‑M1/3‑1 (MQ=255) ttgataaaaagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattttt < 1:660777‑M1/3‑1 (MQ=255) ttgataaaaagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattttt < 1:247315‑M1/3‑1 (MQ=255) gTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAACGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAAttt < 2:1486813/149‑1 (MQ=255) tGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAAtttt < 1:300607/149‑1 (MQ=255) gataaagagcactactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtaaggaagatgaaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcaatatattgaggtaaaggatttaactacatccatgcgacaattTTTTa > 4:1460714‑M1/145‑149 (MQ=255) gataaaaagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTa > 1:986611‑M1/145‑149 (MQ=255) gataaaaagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTa < 4:511011‑M1/5‑1 (MQ=255) ataaaaagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTAt > 1:970392‑M1/144‑149 (MQ=255) aTTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTAt < 2:700164/149‑1 (MQ=255) ttACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGa > 1:1325164/1‑149 (MQ=255) ttACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGa < 3:1274029/149‑1 (MQ=255) aaagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattttt < 3:476520‑M1/3‑1 (MQ=255) aagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTATGACca > 2:1473546‑M1/139‑149 (MQ=255) aagcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTATGACca > 3:167967‑M1/139‑149 (MQ=255) agcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTATGACcac < 4:1717539‑M1/12‑1 (MQ=255) agcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTATGACcac < 3:342783‑M1/12‑1 (MQ=255) agcaatactacgaggcaaacctggcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTATGACcac < 1:693800‑M1/12‑1 (MQ=255) gcaagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACaa > 2:1592232/1‑149 (MQ=255) gcaagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACaa > 2:800279/1‑149 (MQ=255) caagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAAc < 1:107586/149‑1 (MQ=255) caagGGTATGATTACGCTATTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGATGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAAc < 4:1389303/149‑1 (MQ=255) aagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAAcc < 4:1669435/149‑1 (MQ=255) gTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTc < 4:433224/149‑1 (MQ=255) aTTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTAtt > 4:808591/1‑149 (MQ=255) aTTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTAtt < 4:1298145/149‑1 (MQ=255) cGCTTTTTAAAGCGTATCATAAAACATAACATAATAAAAGATTTGTGATGACACGGGAGTATTGCGCTTTACTTTGAGGAATATAAATTGCGAGTTTAGAGCACCGCGGGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTgg > 3:1074550/1‑149 (MQ=255) cGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTgg > 4:1118326/1‑149 (MQ=255) gCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGt > 4:430968/1‑149 (MQ=255) cTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTc > 1:146042/1‑149 (MQ=255) tttttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCa > 4:1529288/1‑149 (MQ=255) gcgcttaaaggtgcggaagatggaatcatcgtcgatagcgaagcactgtttgtgaactaatgctgacaggcagtatattgaggtaaaggatttaactccctccagccgacaattTTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATaa > 1:341790‑M1/115‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) ataAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCtt < 4:1082062/149‑1 (MQ=255) aaaaTGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAAGATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCg < 3:1118326/149‑1 (MQ=255) aaaTGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGc < 2:845684/149‑1 (MQ=255) aTGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGc > 3:1474539/1‑115 (MQ=255) tttATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATcgacga < 3:322054/149‑1 (MQ=255) ataGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATCGACgatga > 3:69347/1‑149 (MQ=255) taGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATCGACgatgat > 3:732829/1‑149 (MQ=255) aGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCAtt > 1:1167140/1‑114 (MQ=255) aGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCAtt < 2:1167140/114‑1 (MQ=255) gCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATCGACGATGATTc > 2:469985/1‑149 (MQ=255) ctccctccagccgacaattTTTTATGACCACAATACGACAGGTTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATcga > 3:1328205‑M1/20‑139 (MQ=255) cACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATCGACGATGATTcc < 4:1248242/149‑1 (MQ=255) ccGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATCGACGATGATTCCAt > 1:1653266/1‑149 (MQ=255) aataatTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATAc < 4:1586753/84‑1 (MQ=255) aataatTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATAc > 3:1586753/1‑84 (MQ=255) aataatTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGt > 4:358410/1‑101 (MQ=255) | CGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGAGGGAGTTAAATCCTTTACCTCAATATACTGCCTGTCAGCATTAGTTCACAAACAGTGCTTCGCTATCGACGATGATTCCATCTTCCGCACCTTTAA > NC_000913/2493528‑2493822 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |