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CTTTCACCGAACCTGCCGGGTTATTGCCTTCCAGTTTTAACCACACTTCACTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTT > NC_000913/2539460‑2539756 | cTTTCACCGAACCTGCCGGGTTATTGCCTTCCAGTTTTAACCACACTTCACTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGc < 1:70815/149‑1 (MQ=255) tttCACCGAACCTGCCGGGTTATTGCCTTCCAGTTTTAACCACACTTCACTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGcc > 2:681231/1‑149 (MQ=255) tttCACCGAACCTGCCGGGTTATTGCCTTCCAGTTTTAACCACACTTCACTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGcc > 3:982163/1‑149 (MQ=255) 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aTCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCga < 2:1760258/149‑1 (MQ=255) aTCCCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAAc < 3:1453940/129‑1 (MQ=255) ctctATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCgaga < 4:715737/149‑1 (MQ=255) ctATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCa < 2:250288/131‑1 (MQ=255) ctATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGc < 3:1231189/149‑1 (MQ=255) tCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCa > 4:1423031/1‑116 (MQ=255) tCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAg > 4:1464733/1‑149 (MQ=255) cATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGtt > 2:425164/1‑149 (MQ=255) aTACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCACCCTACCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCCAGTTc < 4:1097961/149‑1 (MQ=255) aTACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTc > 2:1052497/1‑149 (MQ=255) aTACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTc > 2:504556/1‑149 (MQ=255) gtggtgTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTc > 2:345146/1‑148 (MQ=255) gtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATcgcg < 1:504556/149‑1 (MQ=255) ttGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCgg < 2:1420565/149‑1 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCggg < 3:211286/149‑1 (MQ=255) CCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTaa > 2:15633‑M1/1‑94 (MQ=255) | CTTTCACCGAACCTGCCGGGTTATTGCCTTCCAGTTTTAACCACACTTCACTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTT > NC_000913/2539460‑2539756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |