New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4551421 | 388 (1.430) | 8 (0.030) | 14/240 | NT | 2.1% | intergenic (‑125/‑215) | gntP/uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase |
? | NC_000913 | = 4551422 | 391 (1.540) | intergenic (‑126/‑214) | gntP/uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AATACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4551265‑4551421 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgctgcaaATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATTCTCT < NC_000913/4551422‑4551275 AATACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTT > 1:1454492/1‑149 AATACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTT > 3:1136447/1‑149 ATACCACCCAGAGAATTTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGTTTGAACCGATGTTATTTTGGGAGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACACCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTT < 2:1497235/149‑1 ATACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTT < 1:1703975/149‑1 TACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTG < 3:1995001/149‑1 TACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTG < 1:599196/149‑1 ACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCACCGATTACCCTTTGC < 3:189187/149‑1 CACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTG > 1:726916/1‑149 ACCCAGAGAATGTTGAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC > 2:1845265/1‑149 ACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC > 2:2439389/1‑149 ACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC > 4:1249070/1‑149 ACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC > 2:1760352/1‑149 ACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC > 4:1556698/1‑149 ACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC > 4:473716/1‑149 ACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC > 1:1312712/1‑149 CCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCA > 3:1148244/1‑149 CCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCA > 1:1361890/1‑149 CCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAA > 1:661352/1‑149 CCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAA > 1:1497319/1‑149 CCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAA > 2:481136/1‑149 CCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTG < 4:1466697/143‑1 CCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTG > 3:1466697/1‑143 TACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGC < 1:2374293/113‑1 TACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGC > 2:2374293/1‑113 GTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGG < 4:49205/137‑1 GTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGG > 3:49205/1‑137 ATCCTCTGATCAATAACCATCGATTGCCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAA < 3:2176082/135‑1 ATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGTCCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAA > 4:2176082/1‑135 ATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAG < 1:1209535/132‑1 ATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAG > 2:1209535/1‑132 ATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCTAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCAT > 4:1076890/1‑149 ATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCTAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCAT < 3:1076890/149‑1 CCTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCT > 4:1939744/1‑149 CTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAA < 4:1399669/90‑1 CTTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAA > 3:1399669/1‑90 TTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACA < 2:993825/91‑1 TTTGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACA > 1:993825/1‑91 TTTGCTGCAATTGGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATGCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACATTATGCATGTGCTTA > 4:570895/1‑149 TTTGCTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTA > 2:661352/1‑149 TTGCTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAA < 4:841034/149‑1 TTGCTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAA > 1:237003/1‑149 TGCTGCAATTTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAAC > 1:1467648/1‑149 TGCTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAAC < 2:1257562/149‑1 GCTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGTTGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACA < 1:1227210/149‑1 GCTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACA < 1:2184184/149‑1 CTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTC < 3:466204/111‑1 CTGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTC > 4:466204/1‑111 TGCAAATTGCAGCCAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCCGCGGATGTCGCATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGTCCAAAATAACAACGGTTTAACCAGCTAAGGTAATACGATATGAATGTGCTCAACATT > 2:1929163/1‑149 TGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATT > 1:410731/1‑149 TGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATT > 4:580056/1‑149 TGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATT > 4:373153/1‑149 TGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATT > 4:1141164/1‑149 TGCAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTGGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATT > 1:631093/1‑149 CAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATTCT < 1:1623711/149‑1 CAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGT > 2:1855293/1‑121 CAAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGT < 1:1855293/121‑1 AAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATTCTC < 4:605500/149‑1 AAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATTCTC < 3:2221284/149‑1 AAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCACAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATCCTC < 2:2065514/149‑1 AAATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTCATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATTCTC < 4:1034892/149‑1 AATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACACTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATTCTCT > 3:2184391/1‑149 AATACCACCCAGAGAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4551265‑4551421 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgctgcaaATTGCAGCAAAGGGTAATCGATGGTTATTGATCAGAGGATGTGACATTCATCGCAACAATGGTTGACCAATTTACATAACATATCGCCCAAAATAACAACGGTTCAACCAGGTAAGGTAAAACGTTATGCATGTGCTTAACATTCTCT < NC_000913/4551422‑4551275 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |