| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1546257 = | 182 (0.670) | 11 (0.040) | 9/248 | NT | 5.7% | intergenic (‑229/+31) | yddL/yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| ? | NC_000913 | 1546286 = | 190 (0.730) | intergenic (‑258/+2) | yddL/yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAGCGCTGAG > NC_000913/1546109‑1546402 | taggttcgtattttacgcctgtactttcctcagcgcttgcagccgtgctgctcagcgccccgctgtcgttctcgttctggcaaggcgcgctgatggtctgcggcggttccctgctctgctggctggcgacacgtcgtggttaaaaTAAc < 4:2074610‑M1/4‑1 (MQ=255) tAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc < 3:907237/149‑1 (MQ=255) aaaaGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTGTTTGAAATTAATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTAc > 4:194688/4‑149 (MQ=255) aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTAc > 3:550326/1‑149 (MQ=255) tAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg > 1:307442/1‑149 (MQ=255) ttAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAcc > 4:2157647/1‑149 (MQ=255) aaaCAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGc > 4:2338496/1‑149 (MQ=255) aaCAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATTAAATATAAGGTGAATTACTGGTAGTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCa < 2:1855028/149‑1 (MQ=255) aCAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAccc < 4:1268758/144‑1 (MQ=255) ctttcctcagcgcttgcagccgtgctgctcagcgccccgctgtcgttctcgttctggcaaggcgcgctgatggtctgcggcggttccctgctctgctggctggcgacacgtcgtggttaaaaTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGt > 3:2110309‑M1/123‑149 (MQ=255) ctttcctcagcgcttgcagccgtgctgctcagcgccccgctgtcgttctcgttctggcaaggcgcgctgatggtctgcggcggttccctgctctgctggctggcgacacgtcgtggttaaaaTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGt > 1:1523067‑M1/123‑149 (MQ=255) tGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAt < 1:1034619/149‑1 (MQ=255) tGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAt < 4:1345531/149‑1 (MQ=255) tGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAt < 1:2409389/149‑1 (MQ=255) gaAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAtttt > 3:1133888/1‑149 (MQ=255) aaaaTAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTaa < 1:1169549/149‑1 (MQ=255) aaaaTAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTaa < 2:926964/149‑1 (MQ=255) aaaaTAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTaa < 4:506130/149‑1 (MQ=255) aaaTAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc > 3:1418297/1‑117 (MQ=255) tAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGTGCCGTAGACCCGGCAGTTATATTAACCac > 2:15957/1‑149 (MQ=255) gAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACgt > 3:761636/1‑149 (MQ=255) gAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACgt > 2:2473998/1‑149 (MQ=255) gAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGGCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACgt < 3:830372/149‑1 (MQ=255) agccgtgctgctcagcgccccgctgtcgttctcgttctggcaaggcgcgctgatggtctgcggcggttccctgctctgctggctggcgacacgtcgtggttaaaaTAACTGCCGGGCCGTAGACCCGGCa > 3:424146‑M1/106‑130 (MQ=255) aaaTAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGAtt < 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gAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGc > 3:2002653/1‑149 (MQ=255) aTTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCaa > 2:1325631/1‑149 (MQ=255) aTTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCaa < 1:2502949/149‑1 (MQ=255) ttATCTTATTAACTAACGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGACAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAgc < 3:194688/149‑1 (MQ=255) tGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAGCGCTGa > 2:2157639/1‑149 (MQ=255) tGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAGCGCTGa < 1:15073/149‑1 (MQ=255) tGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAGCGCTGa < 2:1179698/149‑1 (MQ=255) tGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAGCGCTGa < 4:761636/149‑1 (MQ=255) tGATTAACTACCGCGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAGCGCTGa < 4:707434/149‑1 (MQ=255) gATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCa > 3:1114284/1‑84 (MQ=255) gATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCg < 1:741154/117‑1 (MQ=255) gATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCg > 2:741154/1‑117 (MQ=255) | TTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTTAACCACGACGTGTCGCCAGCCAGCAGAGCAGGGAACCGCCGCAGACCATCAGCGCGCCTTGCCAGAACGAGAACGACAGCGGGGCGCTGAGCAGCACGGCTGCAAGCGCTGAG > NC_000913/1546109‑1546402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |