| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3383284 = | 239 (0.880) | 19 (0.080) | 15/234 | NT | 8.2% | intergenic (+17/+46) | degS/mdh | serine endoprotease, periplasmic/malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 3383314 = | 208 (0.840) | intergenic (+47/+16) | degS/mdh | serine endoprotease, periplasmic/malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding | |||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
ATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGAT > NC_000913/3383136‑3383432 | taaaaacggcgtggaagagcgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataataaaaaa < 4:2066956‑M1/6‑1 (MQ=255) taaaaacggcgtggaagagcgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataataaaaaa > 2:2225990‑M1/144‑149 (MQ=255) aaacggcgtggaagagcgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCg < 4:1869056‑M1/9‑1 (MQ=255) aaacggcgtggaagagcgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCg > 2:2383534‑M1/141‑149 (MQ=255) tgGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGa < 1:903104/149‑1 (MQ=255) tgGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGa < 3:1072451/149‑1 (MQ=255) acggcgtggaagagcgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGa > 1:1692902‑M1/139‑149 (MQ=255) acggcgtggaagagcgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGa > 1:1940506‑M1/139‑149 (MQ=255) cggcgtggaagagcgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAg > 4:934816‑M1/138‑149 (MQ=255) gagaCGGTGGATCAGGTGACGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATGCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCATCATTCAGGAATATCCGGCGACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAAACGGAGt > 4:192425/1‑149 (MQ=255) gATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAGAAAACCGGAGTCtgtg > 4:838273/1‑149 (MQ=255) gATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCtgtg > 1:1046008/1‑149 (MQ=255) gATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCtgtg > 1:715757/1‑149 (MQ=255) aTGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTcaaaacaaaa < 3:2050903/134‑1 (MQ=255) aTGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGc > 2:1212830/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTGGCGGACATTCGCGCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCACAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCg < 2:1684578/149‑1 (MQ=255) tCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCgg < 3:2106891/149‑1 (MQ=255) cgtaaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGt > 2:576678‑M1/125‑149 (MQ=255) taaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGttt > 1:1405904‑M1/123‑149 (MQ=255) taaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataacAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGttt > 4:144304‑M1/123‑149 (MQ=255) gTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCTAACCCAAAATCCGGAGTCTGTGCTCCGGtgat < 2:795247/149‑4 (MQ=255) aaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGtttt > 3:1865402‑M1/122‑149 (MQ=255) aaatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataacAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGtttt > 1:243468‑M1/122‑149 (MQ=255) tGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGttttt < 4:916461/149‑1 (MQ=255) aatctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGttttt > 3:899911‑M1/121‑149 (MQ=255) cGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCAGCAACCAATTTAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTttat < 2:215369/149‑1 (MQ=255) ggAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCATGTCACCATTCAGCAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTttatt > 2:2031183/1‑149 (MQ=255) ggAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACAGGAGTCTGTGCTCCGGtttt > 2:1132876/1‑144 (MQ=255) aaTTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATc < 1:697559/149‑1 (MQ=255) tCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGc > 1:199237/1‑149 (MQ=255) cTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATc > 3:401655/1‑149 (MQ=255) ggTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCaa > 4:1348359/1‑149 (MQ=255) gTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAAt < 3:1779163/149‑1 (MQ=255) ttCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAAtt > 1:1734577/1‑149 (MQ=255) tCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTa < 3:782498/149‑1 (MQ=255) ggTGATCCCTGTACTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACt < 4:1570575/149‑1 (MQ=255) aTCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatt > 1:797480/1‑149 (MQ=255) ccTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAAc < 1:1116332/149‑1 (MQ=255) cTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAAc < 2:130596/97‑1 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ggCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCt > 3:48690/1‑149 (MQ=255) ggCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCt < 4:748434/149‑1 (MQ=255) aaCCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGtt < 1:1228802/149‑1 (MQ=255) aaCCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGtt > 3:161897/1‑149 (MQ=255) aCCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTc < 4:1728636/149‑1 (MQ=255) 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4:2198349/149‑1 (MQ=255) aGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAggg < 4:813048/92‑1 (MQ=255) gcTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGaa > 2:2454763/1‑70 (MQ=255) cTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAc < 3:315123/149‑1 (MQ=255) cTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCACCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAc < 2:1911053/149‑1 (MQ=255) tCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAcc > 3:2149916/1‑149 (MQ=255) tCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCACCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAcc > 1:1306987/1‑149 (MQ=255) caaaacaaaaAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCg < 1:2292699/149‑1 (MQ=255) aaacaaaaAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAAt < 4:2012780/132‑1 (MQ=255) aacaaaaAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATa > 4:2296168/1‑149 (MQ=255) aacaaaaAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATa > 1:55430/1‑149 (MQ=255) aacaaaaAACCGGAGTCTGTGCTACGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATa < 4:3609/149‑1 (MQ=255) caaaaAACCCGGGTCTGGGGTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACCTATTAACGGACTCCTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCATCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGa < 4:111195/149‑1 (MQ=255) | ATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGAT > NC_000913/3383136‑3383432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |