| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3622041 | NA (NA) | 6 (0.020) | 5/246 | NT | 100% | coding (2850/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3622077 | 0 (0.000) | coding (2886/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTGTGGCGGCGTGAACGGGACC > NC_000913/3621929‑3622225 | cGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAG > 3:1236211‑M2/1‑149 (MQ=255)cGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAG > 1:278068‑M2/1‑149 (MQ=255) ggAGCTGCACCCGGACAGCAACCTCAGCATGTGGCCGGATATCCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTTACAGAGGAAACCGACCACATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGg > 4:321040‑M2/1‑148 (MQ=255) tCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAG > 4:2363814‑M2/1‑82 (MQ=255) tCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAG < 3:2363814‑M2/82‑1 (MQ=255) gCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAG < 2:716267‑M2/59‑1 (MQ=255) gCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAG > 1:716267‑M2/1‑59 (MQ=255) aaCCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgc < 4:1046916‑M2/149‑107 (MQ=255) gACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagct < 3:2391063‑M2/149‑111 (MQ=255) ccTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgg > 4:2447562‑M2/1‑37 (MQ=255) ccTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgg < 3:2447562‑M2/139‑103 (MQ=255) tCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGA‑‑‑Ggtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggcgctgtccgggtgcagctccgggtc < 3:2157640‑M2/149‑118 (MQ=255) ggggTTATCCGCACGGATGATGAGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggc > 3:1046916‑M2/1‑24 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctg < 1:1163180‑M2/149‑144 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctg < 1:629417‑M2/149‑144 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgg < 1:2477166‑M2/108‑103 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgg > 2:2477166‑M2/1‑6 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgaggg > 1:922723‑M2/1‑6 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgaggg < 2:922723‑M2/98‑93 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttat > 3:1407007‑M2/1‑6 (MQ=255) gatgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttat < 4:1407007‑M2/80‑75 (MQ=255) atggGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgatggtcataccggaaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctctgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 2:1277263‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatcgggccacatgccgagggtgctgcccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgg > 1:534972‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 3:1378217‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 4:817830‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 4:893466‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 1:1185177‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 2:650218‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 2:2285727‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 1:349419‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 1:2164079‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 1:2148438‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt < 2:1280242‑M2/149‑145 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 1:1814858‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgt > 2:1054427‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttac > 3:1047948‑M2/1‑5 (MQ=255) atgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttac < 4:1047948‑M2/136‑132 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgttgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 4:836491‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 1:1482530‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 4:340353‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 1:1213284‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 4:2183170‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 4:1425049‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 4:344469‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 4:629593‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 1:2014199‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg < 3:883932‑M2/149‑146 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 3:529941‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 1:1219202‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 2:1844471‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 3:1798557‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 3:1707983‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 2:1439468‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 2:348014‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 3:1440864‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg < 2:584038‑M2/149‑146 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 1:64864‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 2:12576‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 2:103025‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 1:462360‑M2/1‑4 (MQ=255) tgaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 2:1250‑M2/1‑4 (MQ=255) gaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtgg < 3:1060485‑M2/149‑147 (MQ=255) gaGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtgg < 4:259106‑M2/149‑147 (MQ=255) gaGgtcggatttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtgg < 4:2277815‑M2/149‑147 (MQ=255) aGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggc > 2:859816‑M2/1‑2 (MQ=255) aGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggc < 3:1480504‑M2/149‑148 (MQ=255) aGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggc > 3:399686‑M2/1‑2 (MQ=255) aGgtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggc < 2:1720014‑M2/149‑148 (MQ=255) ggtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggca > 1:1710516‑M2/1‑1 (MQ=255) ggtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggca < 1:1356158‑M2/149‑149 (MQ=255) ggtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggca < 3:1347985‑M2/149‑149 (MQ=255) ggtcggttttctctgtcagcctgccgtgacggtcataccggtaaagatagtgcgcgtcacgggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggca > 1:470132‑M2/1‑1 (MQ=255) | CGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTGTGGCGGCGTGAACGGGACC > NC_000913/3621929‑3622225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |