New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4621160 = | 55 (0.720) | 3 (0.040) | 3/162 | NT | 5.8% | coding (278/720 nt) | deoD | purine nucleoside phosphorylase 1; nicotinamide 1‑beta‑D‑riboside phosphorylase |
? | NC_000913 | 4621189 = | 47 (0.670) | coding (307/720 nt) | deoD | purine nucleoside phosphorylase 1; nicotinamide 1‑beta‑D‑riboside phosphorylase | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TGCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGTGC > NC_000913/4621090‑4621288 | tctcatggtctttaaaacggatgcggttaactttggaatcggtgcaggcacccataccgataacgacgtcGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGcgcg > 2:1000439‑M1/71‑100 (MQ=255) tGCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGcgcg > 1:319197/1‑100 (MQ=255) gCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGa > 2:1724173/1‑100 (MQ=255) tCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcg > 1:1348717/1‑100 (MQ=255) catggtctttaaaacggatgcggttaactttggaatcggtgcaggcacccataccgataacgacgtcGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGcgaga < 1:1000442‑M1/33‑3 (MQ=255) cATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgtc > 1:778251/1‑100 (MQ=255) tCTACACGGAAGAGCTGATCACCGATTTGGGCGTGAAGAAACTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCCGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgtc > 2:1199854/1‑98 (MQ=255) cTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGtt > 1:390842/1‑100 (MQ=255) ccAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCgg < 1:424006/100‑1 (MQ=255) ccAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCgg > 1:133143/1‑100 (MQ=255) ccAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCgg > 1:84798/1‑100 (MQ=255) aaaGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTa < 2:824617/100‑1 (MQ=255) aaGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTAt < 1:253905/100‑1 (MQ=255) aaCTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATggg < 1:22183/100‑1 (MQ=255) aaCTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATggg < 2:366458/100‑1 (MQ=255) cTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg > 1:1792343/1‑100 (MQ=255) gATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGcc > 2:548803/1‑100 (MQ=255) gATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGcc > 2:1056775/1‑100 (MQ=255) gATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCACAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGcc < 2:105969/100‑1 (MQ=255) aTCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCt > 1:1170402/1‑100 (MQ=255) cACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGc > 2:1168903/1‑100 (MQ=255) aactttggaatcggtgcaggcacccataccgataacgacgtcGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCAc > 1:820617‑M1/43‑100 (MQ=255) cGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCAcc < 1:182219/100‑1 (MQ=255) cGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCAcc < 1:418412/100‑1 (MQ=255) tCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTc < 1:1116986/100‑1 (MQ=255) tCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCAGGCACCCAtac < 2:522389/100‑3 (MQ=255) cGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTATGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTAGTTATCGGTATGGGTGCATGCACCGAttac > 2:23342/1‑98 (MQ=255) gCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTCCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCaa < 1:759853/100‑1 (MQ=255) gTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATTGGTGCCTGCACCGATTCCAAAg < 2:1208854/100‑1 (MQ=255) gTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAg < 2:51892/100‑1 (MQ=255) tGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGt < 1:893803/100‑1 (MQ=255) tGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGt < 2:79283/100‑1 (MQ=255) gtgcaggcacccataccgataacgacgtcgcgcagttttacgtgcggcagaactgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGtt > 1:820617‑M2/59‑100 (MQ=255) gaagaaAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGtt > 2:739207/1‑100 (MQ=255) aTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCa > 1:1590776/1‑100 (MQ=255) cgTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGtttt < 2:609714/100‑1 (MQ=255) cgTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGtttt < 2:1488799/100‑1 (MQ=255) gggggTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTa < 1:1241853/98‑1 (MQ=255) tGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTaa < 2:1590471/100‑1 (MQ=255) gggTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTaaa > 1:337517/1‑100 (MQ=255) ttCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGAc < 1:1978847/100‑1 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCa > 1:1125060/1‑100 (MQ=255) cTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCa > 1:297178/1‑99 (MQ=255) tctcgcgcagttttacgtgcggcagaactgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATg < 1:1000442‑M2/67‑1 (MQ=255) gtgGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGa > 2:867078/1‑100 (MQ=255) gtgGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGa < 2:736817/100‑1 (MQ=255) gtgGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGa < 1:94572/100‑1 (MQ=255) gtgGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGa < 1:94543/100‑1 (MQ=255) ggCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGAACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACt < 2:778248/100‑1 (MQ=255) cgcgcagttttacgtgcggcagaactgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCAtgaga > 2:1000439‑M2/31‑98 (MQ=255) AGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGcc > 2:1579352‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTa > 2:29429/1‑100 (MQ=255) gCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATc > 1:1242736/1‑100 (MQ=255) cACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTg < 1:867081/100‑1 (MQ=255) cACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTg < 1:145834/100‑1 (MQ=255) cACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTg > 2:338498/1‑100 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGa < 2:1728265/100‑1 (MQ=255) cGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGAc > 1:48157/1‑100 (MQ=255) cGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGAc < 2:866260/100‑1 (MQ=255) cGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGAc > 1:1545842/1‑100 (MQ=255) tAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACtt > 2:1747366/1‑100 (MQ=255) tAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACtt > 1:1206601/1‑100 (MQ=255) tAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACtt > 1:2029594/1‑100 (MQ=255) tAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCCGCACCGATTCCAAAGGTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGa < 2:1728182/97‑1 (MQ=255) aactgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGa > 1:1277505‑M2/9‑100 (MQ=255) actgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGAc > 1:894416‑M2/8‑100 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACa < 1:29430‑M2/94‑1 (MQ=255) tgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACAt > 1:1965493‑M2/6‑100 (MQ=255) gcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGt < 2:1300617‑M2/98‑1 (MQ=255) cGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGTg < 2:1450037‑M2/99‑1 (MQ=255) gACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGTGc < 2:595010/100‑1 (MQ=255) gACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGTGc > 2:456281/1‑100 (MQ=255) | TGCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGTGC > NC_000913/4621090‑4621288 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |