| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 226704 = | NA (NA) | 9 (0.070) | 5/170 | NT | NA | noncoding (946/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | 226730 = | NA (NA) | noncoding (972/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/226806‑226704‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAGAA > NC_000913/226730‑226828 TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC < 1:3189060/100‑1TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC > 1:1381814/1‑100TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC > 2:1283457/1‑100TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC < 2:3420779/100‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |