| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 385205 | 127 (0.910) | 25 (0.200) | 12/162 | NT | 16.9% | intergenic (‑589/‑27) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | = 385217 | 130 (1.020) | intergenic (‑601/‑15) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/385099‑385205‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctcccCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCTA < NC_000913/385217‑385119 TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC < 1:950692/100‑1TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC < 1:3457075/100‑1TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC < 1:2915632/100‑1TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC < 1:1573247/100‑1TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC > 2:3334969/1‑100TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC < 2:3408019/100‑1TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC > 2:3390292/1‑100 TGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTTTTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCTTGAATACT > 1:1201240/1‑100 TGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACT < 1:1773967/100‑1 GCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTG < 1:1149379/100‑1 GCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACT > 1:3566619/1‑99 CATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGC < 2:2659604/100‑1 ATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGC < 1:3369225/99‑1 TATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTC < 2:2412914/100‑1 TATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTC < 2:1939927/100‑1 ATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC < 1:1943667/100‑1 ATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC > 2:1113863/1‑100 ATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC < 2:1681140/100‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC > 2:1412489/1‑100 TAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGTTTTTAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCtat > 1:2734110/1‑97 GCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGG < 2:505594/100‑1 GTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGC < 1:133427/100‑1 TTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAG < 1:1129153/100‑1 TTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAG < 1:161252/100‑1 TTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAG < 2:1592114/100‑1 TTTTTTGCTAAGAATAAAATCAGCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGCCTTGTTATGGGAGCAn < 2:1737333/100‑2 TTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGT < 2:3737092/100‑1 TTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGT < 2:202504/100‑1 TTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGT < 2:3593472/100‑1 TTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTA < 2:688116/100‑1 TTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTAT < 2:1724071/100‑1 TTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATT < 2:3350799/100‑1 TTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATT < 2:2004252/100‑1 TTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATT < 1:3464457/100‑1 ttCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATCCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTC < 1:1733993/98‑1 ggTAAGAATAAAAGCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTAGTCCTGAATACGGCACCCCTGTCATGTTATGGGAGCAGTAT < 1:50224/95‑1 gatctGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCA < 2:246878/95‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCTATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAG < 1:1327913/100‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAG < 2:1421746/100‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAG < 2:137897/100‑1 TAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGG < 1:1478794/100‑1 TAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGG < 2:2496919/100‑1 AGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAA < 2:2336356/100‑1 GAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAagatc > 1:246876/1‑95 TCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTAT < 2:237985/100‑1 CTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAA < 2:1212787/100‑1 TGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAA > 1:1359326/1‑100 GCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAAC > 2:974915/1‑100 GCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAAC > 2:235676/1‑100 GCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAAC > 1:942540/1‑100 GCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAAC > 1:2411918/1‑100 GCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAAC > 2:1751971/1‑100 GCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAAC > 2:1885164/1‑100 TCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGG < 2:3301399/100‑1 TCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAAC < 2:3805376/98‑1 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGTATTAGTCGTGATCGCACAGATGATATTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 1:2620786/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC < 2:962205/100‑1 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 2:2754825/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 2:2860040/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 2:2560227/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 2:737385/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC < 2:250434/100‑1 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 1:1711543/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC < 2:1566830/100‑1 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 2:647887/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATAGCACAGATGAATTTATTCTTAGCAAAAAAACGG > 1:372234/1‑99 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCT < 2:3527747/100‑1 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCT > 2:2754133/1‑100 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCT > 2:2752005/1‑100 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC < 1:16254/99‑1 CCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCTA > 2:455224/1‑100 CCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCTA > 1:895942/1‑100 TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/385099‑385205‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctcccCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCTA < NC_000913/385217‑385119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |