| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620614 | NA (NA) | 22 (0.170) | 11/166 | NT | 100% | coding (1423/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620635 | 0 (0.000) | coding (1444/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620516‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC < 2:1869753/100‑1CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC < 1:1437959/100‑1 AGAGTAGAGCCCGGATGCGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:2733677/100‑1 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 2:2463823/100‑1 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 2:2817676/100‑1 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:413570/100‑1 AGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC < 2:1591724/100‑1 AGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC < 1:3579673/100‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATTGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGATAACGTCA > 2:1524115/1‑100 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAGCCACCACAACCAGTTAACGTCA < 1:1041126/100‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCA < 2:2248292/100‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCA > 2:2094666/1‑100 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:3365994/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG > 2:1136623/1‑100 TACAGCCCGGATGTGGGGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTCCTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 1:1051751/100‑1 TGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGA < 1:807197/100‑1 TGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGT < 1:2989186/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 2:1953355/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 1:3838854/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 2:2578752/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:2792769/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:2541982/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:203034/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:1750336/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:802820/100‑1 CGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAA < 2:1514996/100‑1 CGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAA < 2:657081/100‑1 CGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:3289033/99‑1 GGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 1:2041144/100‑1 GCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTG < 2:2278440/100‑1 CCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGC > 1:2844443/1‑100 CACCACAACCAGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCG > 2:2660856/1‑100 ACCAGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAG > 1:2860510/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGG > 2:3143970/1‑100 CAGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGG > 1:2348356/1‑99 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 2:2488817/1‑100 AGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGG > 1:1635211/1‑98 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:2932571/1‑100 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:3277349/1‑100 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:2098487/1‑100 agccggtgAGGC‑CCGGTGGTTGACGTTAACTGGTTGTGGGGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGC < 2:1692768/89‑1 gccgggCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAACCGCGGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC < 1:1638903/91‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 1:236361/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 1:1653694/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 2:902445/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTC < 1:1844179/98‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTTGTTATAGTAAATCGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:2877323/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 1:1009651/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACGGGTTGTGGTGGTTATAGTAAACCGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:3232843/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA > 1:3317923/1‑100 CAGGC‑CCTGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 1:1762299/99‑1 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC > 1:1942539/1‑100 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC < 2:934155/100‑1 AGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACA < 1:3507542/100‑1 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCTGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:1185604/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:2219846/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:1612996/1‑100 CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620516‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |