| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,247,894 | G→T | 16.7% | G41V (GGC→GTC) | yqjA → | general envelope maintenance protein; DedA family inner membrane protein; putative multidrug efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,247,894 | 0 | G | T | 16.7% | 362.5 / 54.4 | 142 | G41V (GGC→GTC) | yqjA | general envelope maintenance protein; DedA family inner membrane protein; putative multidrug efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (58/59); new base T (12/12); total (70/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TGCAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGATTCTGC > NC_000913/3247795‑3247992 | tgcAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACgg > 2:909634/1‑100 (MQ=255) gcAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACgg > 2:54798/1‑99 (MQ=255) gcAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgc > 1:2356963/1‑100 (MQ=255) cAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgct < 2:3098252/100‑1 (MQ=255) cAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgct > 2:290412/1‑100 (MQ=255) cAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATACATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgct < 1:2817722/100‑1 (MQ=255) aaGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGtctt < 1:3553562/100‑1 (MQ=255) aaGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgctt < 1:202087/100‑1 (MQ=255) aGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgcttg > 2:243375/1‑100 (MQ=255) gCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgcttgc < 2:3726993/100‑1 (MQ=255) gCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGgcttgc > 1:3675468/1‑100 (MQ=255) gCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTAGTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGacttgc > 1:2640653/1‑100 (MQ=255) gtgGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCcg < 1:536469/100‑1 (MQ=255) gtgGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCcg > 2:2126905/1‑100 (MQ=255) gggCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCGTCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCcggc < 2:3486268/100‑1 (MQ=255) gggCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCcggc < 1:2805281/100‑1 (MQ=255) ggCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCcggcg > 2:1673015/1‑100 (MQ=255) gcgcAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCcggcgg < 2:2271954/100‑1 (MQ=255) gcgcAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCcgccgg > 2:1100551/1‑100 (MQ=255) cgcAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATAGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAACCGGCCTGCTTCcggcg < 1:777182/98‑1 (MQ=255) gcAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGcc < 2:3264162/100‑1 (MQ=255) gcAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGcc > 1:112256/1‑100 (MQ=255) cAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCt > 1:1781165/1‑100 (MQ=255) ggATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCttt < 2:2160467/100‑1 (MQ=255) ttttGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTa < 1:2184919/100‑1 (MQ=255) tttGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTAc > 2:3061393/1‑100 (MQ=255) tGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCg > 1:1441273/1‑100 (MQ=255) aaCCTTGGTCAATCCATTGAT‑GATTTGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGc < 2:1880982/100‑1 (MQ=255) aCCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCg < 2:2839626/100‑1 (MQ=255) tGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAg < 2:1334855/100‑1 (MQ=255) atgCCAAT‑CATCGATGGATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAg > 1:3424946/3‑100 (MQ=255) gCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGtt < 1:2698380/100‑1 (MQ=255) gCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGtt > 1:1951062/1‑100 (MQ=255) gCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCGTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGtt < 2:2017963/100‑1 (MQ=255) ccAATCCATCGAT‑GCTTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTACTTTTGTTCGTTGAACACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGtt > 1:2387488/1‑99 (MQ=255) ccAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGttt > 1:2054324/1‑100 (MQ=255) ccAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGttt > 1:2429518/1‑100 (MQ=255) cAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGttt < 2:1143829/99‑1 (MQ=255) cAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTa > 1:1735124/1‑100 (MQ=255) aaTCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTAc < 1:3779880/100‑1 (MQ=255) tccgatctt‑gatTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACt < 2:3150364/91‑1 (MQ=255) tCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACt < 2:1735132/99‑1 (MQ=255) aTCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTa < 1:3808938/100‑1 (MQ=255) aTCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTa > 1:3274857/1‑100 (MQ=255) aTCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTa > 2:414655/1‑100 (MQ=255) ggcaaatccaggCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTa > 2:101386/11‑100 (MQ=255) cGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTAt < 1:2282851/99‑1 (MQ=255) cGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTGGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTAtt < 1:757335/100‑1 (MQ=255) cGAT‑GAGTGGCATGTTGTATGTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTAtt < 2:1818449/100‑1 (MQ=255) gat‑gatTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTg > 1:1783826/1‑100 (MQ=255) at‑gatTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTgg < 1:962495/100‑1 (MQ=255) at‑gatTGGCATGTTGTATTTTGTATTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTgg > 1:1869724/1‑100 (MQ=255) t‑gatTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGt < 1:2707724/100‑1 (MQ=255) t‑gatTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACtagatcggaa > 1:3150339/1‑91 (MQ=255) ggCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCg > 2:132022/1‑100 (MQ=255) ggCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCGTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCg > 1:2873351/1‑100 (MQ=255) cATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCgtg > 2:409708/1‑100 (MQ=255) cATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCGTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCgtg < 1:1212004/100‑1 (MQ=255) aTGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCgtgt < 2:2815572/100‑1 (MQ=255) aTGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCgtgt < 1:565379/100‑1 (MQ=255) tgttgtATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt < 2:1508895/100‑1 (MQ=255) tgtATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTCTTGAt > 1:3289601/1‑100 (MQ=255) gtATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGAtt < 2:3483996/100‑1 (MQ=255) tATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTg < 2:2586846/100‑1 (MQ=255) aTTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGc > 2:538808/1‑100 (MQ=255) aTTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGc > 1:1028261/1‑100 (MQ=255) ttGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGaa < 1:1302272/100‑1 (MQ=255) tGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGaaa < 2:1620590/100‑1 (MQ=255) tGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGaaa < 2:896737/100‑1 (MQ=255) gTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAg < 1:1961485/100‑1 (MQ=255) gTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAg > 1:163572/1‑100 (MQ=255) tCTTGTTTGTATTGTTGTTCCTTGAAAGAGACTTGCTTCCTGCGGCGTTTTTACCGTGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGaa < 1:3514433/97‑1 (MQ=255) tCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAgg < 1:1570714/100‑1 (MQ=255) tCTTGTTTGTAATTTGTTTCCTGGAAAGCGGCGTGCTTCCTGGTGCCTTTTTTCCGGGTGACAGTTTACTGGTATGGGTCGGCGTGTTGATTGCGaa < 1:3514362/97‑1 (MQ=255) cTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGgc > 2:2210765/1‑100 (MQ=255) ttgtAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGAt > 2:730483/1‑100 (MQ=255) gtAATTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATgg > 2:645106/1‑100 (MQ=255) tAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATggg < 2:1355218/100‑1 (MQ=255) aaTTTTGTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGc > 1:453456/1‑100 (MQ=255) aaTTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGc < 2:3131217/100‑1 (MQ=255) aaTTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGc < 1:3140639/100‑1 (MQ=255) ttGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATc < 2:3211811/100‑1 (MQ=255) tGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATcc < 1:70215/100‑1 (MQ=255) gTTCCTTGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCg > 1:2192784/1‑100 (MQ=255) tccgtGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCGTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCTAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCa < 1:3740682/96‑1 (MQ=255) tCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCa > 2:614391/1‑100 (MQ=255) cgtGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCaaa > 1:2583143/3‑100 (MQ=255) cTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCaaa > 1:2014782/1‑100 (MQ=255) cTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGCGCGACAGTTTACTGGTATTGGCCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCaaa > 1:92674/1‑100 (MQ=255) ttGAAAACGTCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAAc > 2:3402191/1‑100 (MQ=255) ttGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAAc < 2:170756/100‑1 (MQ=255) ttGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTGTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGGTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAAc > 2:1663602/1‑100 (MQ=255) tGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACg > 2:1082801/1‑100 (MQ=255) aaaaCGGCTTGCTTCCGGCGGGCTGTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGAt > 1:3089159/1‑100 (MQ=255) aaaaCGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGAt < 2:2764778/100‑1 (MQ=255) aaaaCGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGAt > 2:2190156/1‑100 (MQ=255) aaaaCGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGAt < 1:2510080/100‑1 (MQ=255) cGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGATTctg > 2:2419223/1‑100 (MQ=255) ggCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGATTctgc < 2:3393098/100‑1 (MQ=255) ggCTTGCTACCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGATTctgc < 2:3357315/100‑1 (MQ=255) | TGCAAGCCCTGTGGGCGCAGGATTTTGAAACCCTGGCCAATCCATCGAT‑GATTGGCATGTTGTATTTTGTCTTGTTTGTAATTTTGTTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTTGATTGCGAAAGGCGCGATGGGCTATCCGCAAACGATTCTGC > NC_000913/3247795‑3247992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |