Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,335,654 | T→A | 15.7% | intergenic (‑64/+40) | eptA ← / ← adiC | lipid A phosphoethanolamine transferase/arginine:agmatine antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,335,654 | 0 | T | A | 15.7% | 450.2 / 67.9 | 173 | intergenic (‑64/+40) | eptA/adiC | lipid A phosphoethanolamine transferase/arginine:agmatine antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/90); new base A (14/13); total (70/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.77e-01 |
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
ATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAAT > NC_000913/4335555‑4335752 | cAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTc > 2:1100946/1‑99 (MQ=255) aaGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTa < 2:3016881/100‑1 (MQ=255) agagGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTaa < 2:1315717/100‑1 (MQ=255) agagGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCAAACAAAGTGCGCATATGCTCGAAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTaa > 2:665323/1‑100 (MQ=255) gggTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGt > 2:1739319/1‑100 (MQ=255) ggTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACCTCACGGTGTTTCCATCGAACACAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGtt < 1:2508958/100‑1 (MQ=255) gTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTg < 1:3545186/100‑1 (MQ=255) gTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTg < 2:2853499/100‑1 (MQ=255) cTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGc < 2:2594602/100‑1 (MQ=255) cTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTg < 2:3439428/98‑1 (MQ=255) tttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCt < 2:3639181/100‑1 (MQ=255) tttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCt < 2:2600546/100‑1 (MQ=255) ttgttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCt < 2:232929/97‑1 (MQ=255) ttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCt > 1:2180959/1‑99 (MQ=255) ttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCtt < 2:3257507/100‑1 (MQ=255) ttcggtacGCGTTTCAATATCACGGTGTGTCCATACAACAAAGTTCGTATATTTTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCtta < 1:3789233/96‑2 (MQ=16) tagtagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTa < 2:2134466/100‑1 (MQ=255) gtagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATg > 1:2684873/1‑100 (MQ=255) gtagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATg < 2:272387/100‑1 (MQ=255) gtagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATg > 2:3297458/1‑100 (MQ=255) tagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑t > 1:430407/1‑100 (MQ=255) agGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑tt < 2:3228936/100‑1 (MQ=255) ggCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑ttt < 2:1360727/100‑1 (MQ=255) cgcTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGc < 1:3407938/100‑1 (MQ=255) cgcTTCAACATCACGGTGTTTCCATAGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑ttt > 1:2985452/1‑98 (MQ=255) tCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGa < 1:741105/100‑1 (MQ=255) cAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTgg > 2:229837/1‑98 (MQ=255) cAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGAt < 2:373701/100‑1 (MQ=255) aaCATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGAtt > 2:454832/1‑100 (MQ=255) aCATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTa < 1:3111282/100‑1 (MQ=255) aCATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAAACTTAAGGTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTa > 1:2721759/1‑100 (MQ=255) aTCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAg < 2:1739259/100‑1 (MQ=255) cACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAggg < 1:90544/100‑1 (MQ=255) aCGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAgggg < 2:2202461/100‑1 (MQ=255) gtgtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAAt < 1:3661879/100‑1 (MQ=255) tgtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAAtt < 2:705393/100‑1 (MQ=255) gtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTa < 1:1547844/100‑1 (MQ=255) gtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTa > 2:192304/1‑100 (MQ=255) tCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATc < 2:3142149/100‑1 (MQ=255) cATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCtt > 1:3301364/1‑100 (MQ=255) cATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCtt < 2:29796/100‑1 (MQ=255) gAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCt < 1:1692255/100‑1 (MQ=255) aaaGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTAtt < 2:2684893/100‑1 (MQ=255) aaaGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGAAATTAATCTTTGTTTAtt > 1:1040004/1‑100 (MQ=255) aaGTGCGCATATGCTCGCAAAGCGAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTg < 1:505314/100‑1 (MQ=255) aGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTgg > 1:410829/1‑100 (MQ=255) aGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTg < 1:332200/99‑1 (MQ=255) tGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTg < 1:1716397/100‑1 (MQ=255) gcgcATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGc < 2:593600/100‑1 (MQ=255) gcgcATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGc < 1:3433332/100‑1 (MQ=255) cgcATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCa < 2:1898950/100‑1 (MQ=255) cgcATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCa < 2:1762301/100‑1 (MQ=255) cATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATc > 1:1346477/1‑100 (MQ=255) atatGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAATGTTAGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCt < 1:1079382/100‑1 (MQ=255) tatGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTa < 1:1257440/100‑1 (MQ=255) gCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAgg < 2:3208234/100‑1 (MQ=255) gCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAgg < 2:2735211/100‑1 (MQ=255) cTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAggg < 2:1551155/100‑1 (MQ=255) tCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGa > 2:1373155/1‑100 (MQ=255) cGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGAt > 2:1445472/1‑100 (MQ=255) cGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGAt > 2:3315164/1‑100 (MQ=255) aaagcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACg < 2:385363/100‑1 (MQ=255) aagcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACgg > 2:1224087/1‑100 (MQ=255) agcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACggg < 1:21240/100‑1 (MQ=255) agcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACggg < 2:3095816/100‑1 (MQ=255) caaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGtt > 2:3678985/1‑100 (MQ=255) ataaaaGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGttttt > 2:936910/5‑100 (MQ=38) aaTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGttttt > 2:1069026/1‑100 (MQ=255) aaTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGttttt < 1:1551271/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAGCCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATGGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 1:1099159/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAACCTTAAGTTGTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 1:3696255/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 2:2023993/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 2:1047243/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 1:2572805/100‑1 (MQ=255) ttAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGTTTGTCTT‑‑TTATT‑TTTGCTGGATTAAGGAGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 1:2746585/99‑1 (MQ=255) ttAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTGTG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAt < 2:2783865/100‑1 (MQ=255) ttAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAt < 2:2843893/100‑1 (MQ=255) aaGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGTGGAATTTATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAt > 1:2771015/1‑98 (MQ=255) aaGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGt < 2:1839405/100‑1 (MQ=255) aGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTa < 1:988117/100‑1 (MQ=255) aGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTTAATTTTGCTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAt > 2:2798455/1‑100 (MQ=21) gCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAg > 1:2947033/1‑100 (MQ=255) gCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTTAATTTTGCTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATg > 2:507642/1‑100 (MQ=21) gCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGC‑T‑‑TAAT‑‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTCATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGAAACGGGTTTTTATGTAGcc > 2:2449387/1‑100 (MQ=21) ccAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAAGCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGc < 1:276430/100‑1 (MQ=255) ccAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGGTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGttttttttt > 1:3570940/1‑93 (MQ=38) ccAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGc > 2:3797057/1‑100 (MQ=255) ccAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGC‑T‑‑TAAT‑‑TTTGCTGGATTAAGGTCAATTAATCTTTGCGTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGGTTTTa > 1:3612990/1‑92 (MQ=18) cAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGcc > 1:3866018/1‑100 (MQ=255) cAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGTGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGCTTTTATGTAGc > 1:662317/1‑99 (MQ=38) cAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGcc > 1:2005454/1‑100 (MQ=255) cAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGcc > 1:3378807/1‑100 (MQ=255) aCCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCgg > 1:843698/1‑100 (MQ=255) cTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGtt > 1:1348618/1‑100 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg < 1:3764092/100‑1 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg < 2:3858173/100‑1 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg < 1:1781719/100‑1 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg > 1:2759747/1‑100 (MQ=255) aGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTaa < 2:3574871/100‑1 (MQ=255) gTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAAt > 1:3063110/1‑100 (MQ=255) | ATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAAT > NC_000913/4335555‑4335752 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |